More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2874 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  100 
 
 
440 aa  888    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  97.73 
 
 
440 aa  872    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1146  Beta-glucosidase  84.77 
 
 
440 aa  728    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  66.74 
 
 
444 aa  614  1e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  64.77 
 
 
435 aa  598  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  0.0000345699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1944  Beta-glucosidase  63.76 
 
 
433 aa  570  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  50.58 
 
 
443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  44.04 
 
 
446 aa  393  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  46.68 
 
 
453 aa  390  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  47.02 
 
 
458 aa  385  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  45.88 
 
 
451 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  44.85 
 
 
438 aa  386  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  48.96 
 
 
448 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  44.68 
 
 
446 aa  382  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  46.14 
 
 
446 aa  379  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  43.02 
 
 
471 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  46.14 
 
 
446 aa  379  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  47.24 
 
 
478 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  44.37 
 
 
439 aa  373  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  46.28 
 
 
474 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  48.25 
 
 
478 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  44.77 
 
 
474 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  46.04 
 
 
462 aa  364  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  45.16 
 
 
456 aa  364  1e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  47.23 
 
 
467 aa  363  3e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  43.94 
 
 
443 aa  362  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  46.33 
 
 
463 aa  359  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  44.84 
 
 
476 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  45.29 
 
 
448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  45.01 
 
 
444 aa  357  1.9999999999999998e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  44.44 
 
 
450 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  45.75 
 
 
457 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  45.38 
 
 
472 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  47.15 
 
 
453 aa  355  1e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  48.16 
 
 
488 aa  355  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  45.87 
 
 
459 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  43.63 
 
 
443 aa  355  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  44.88 
 
 
478 aa  355  1e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  45.41 
 
 
484 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  45.37 
 
 
463 aa  352  7e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  42.23 
 
 
444 aa  352  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  45.2 
 
 
449 aa  352  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  43.82 
 
 
470 aa  348  8e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  45.96 
 
 
457 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  46.47 
 
 
489 aa  347  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  45.23 
 
 
467 aa  347  3e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  45.75 
 
 
472 aa  346  4e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3917  Beta-glucosidase  47.23 
 
 
455 aa  345  7e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  44.44 
 
 
467 aa  345  8e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  44.34 
 
 
440 aa  345  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  42.86 
 
 
452 aa  345  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  44.57 
 
 
448 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  46.15 
 
 
468 aa  343  4e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  37.72 
 
 
452 aa  343  4e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  43.82 
 
 
457 aa  342  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  41.24 
 
 
451 aa  342  7e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  41.01 
 
 
451 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  41.61 
 
 
447 aa  341  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  46.07 
 
 
482 aa  341  1e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  41.01 
 
 
451 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  45.84 
 
 
466 aa  341  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  42.08 
 
 
443 aa  340  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  44.52 
 
 
450 aa  341  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  45.65 
 
 
500 aa  338  8e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  44.94 
 
 
455 aa  338  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  40.94 
 
 
446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  46.67 
 
 
494 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  48.55 
 
 
472 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  40.98 
 
 
451 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  44.65 
 
 
453 aa  336  5e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  46.22 
 
 
460 aa  335  7.999999999999999e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  45.58 
 
 
439 aa  335  9e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  42.79 
 
 
468 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  43.58 
 
 
487 aa  334  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  45.89 
 
 
482 aa  333  5e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  46.64 
 
 
463 aa  331  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  43.93 
 
 
479 aa  332  1e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  48.83 
 
 
444 aa  330  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  46.89 
 
 
466 aa  330  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  46.34 
 
 
457 aa  330  4e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  44.03 
 
 
485 aa  329  7e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  46.44 
 
 
437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  42.86 
 
 
494 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  43.06 
 
 
452 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  46.68 
 
 
445 aa  327  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  46.6 
 
 
436 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  44.37 
 
 
517 aa  326  6e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  41.32 
 
 
470 aa  325  7e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  44.92 
 
 
458 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  46.46 
 
 
474 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  41.19 
 
 
458 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  44.5 
 
 
447 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  41.96 
 
 
465 aa  321  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  42.76 
 
 
456 aa  322  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  45.37 
 
 
470 aa  321  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  38.71 
 
 
450 aa  318  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  41.14 
 
 
453 aa  318  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  42.4 
 
 
452 aa  317  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3061  beta-galactosidase  42.67 
 
 
456 aa  316  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  41.51 
 
 
458 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>