More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4295 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  100 
 
 
447 aa  939    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  57.3 
 
 
443 aa  541  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  57.17 
 
 
443 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  56.03 
 
 
443 aa  532  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  55.96 
 
 
446 aa  526  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  56.63 
 
 
451 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  56.4 
 
 
451 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  56.63 
 
 
451 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  56.4 
 
 
451 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  55.28 
 
 
470 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  53.83 
 
 
444 aa  508  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  54.95 
 
 
452 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  53.55 
 
 
440 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  56.66 
 
 
452 aa  497  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  52.81 
 
 
463 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  53.17 
 
 
449 aa  491  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  53.6 
 
 
460 aa  464  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  49.55 
 
 
443 aa  432  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  48.28 
 
 
444 aa  425  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  48.28 
 
 
458 aa  426  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  48.76 
 
 
457 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  44.87 
 
 
448 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  48.44 
 
 
472 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  47.27 
 
 
457 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  44.98 
 
 
446 aa  404  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  45.31 
 
 
453 aa  405  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  45.15 
 
 
451 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  45.87 
 
 
484 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  47.03 
 
 
459 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  44.17 
 
 
474 aa  401  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  45.82 
 
 
452 aa  392  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  44.29 
 
 
446 aa  393  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  46.52 
 
 
467 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  46.85 
 
 
467 aa  392  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  44.52 
 
 
446 aa  394  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  45.83 
 
 
439 aa  394  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  42.63 
 
 
478 aa  391  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  45.68 
 
 
457 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  43.68 
 
 
456 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  45.89 
 
 
468 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  42.61 
 
 
472 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  41.83 
 
 
487 aa  382  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  45.55 
 
 
485 aa  385  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  44.99 
 
 
478 aa  381  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  44.59 
 
 
478 aa  382  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  45.67 
 
 
455 aa  381  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  45.23 
 
 
462 aa  378  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  45.43 
 
 
453 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  44.78 
 
 
482 aa  379  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  42.46 
 
 
438 aa  378  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  46.08 
 
 
448 aa  376  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  43.69 
 
 
439 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  42.48 
 
 
476 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  42.56 
 
 
471 aa  375  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  43.95 
 
 
447 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  43.82 
 
 
479 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  44.95 
 
 
436 aa  371  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  42.63 
 
 
452 aa  371  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  40.97 
 
 
491 aa  371  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  42.08 
 
 
474 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  44.25 
 
 
456 aa  365  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  47.03 
 
 
463 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  44.23 
 
 
467 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  42.92 
 
 
458 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  44.39 
 
 
437 aa  364  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  43.46 
 
 
471 aa  363  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  42.99 
 
 
450 aa  363  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  45.43 
 
 
466 aa  363  5.0000000000000005e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  43.93 
 
 
468 aa  362  6e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  42.73 
 
 
465 aa  362  6e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  40.41 
 
 
446 aa  360  3e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  45.96 
 
 
453 aa  358  7e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  43.84 
 
 
488 aa  359  7e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  41.11 
 
 
494 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  42.17 
 
 
517 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  43.57 
 
 
470 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  45.05 
 
 
466 aa  354  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  44.64 
 
 
474 aa  353  5e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3917  Beta-glucosidase  43.61 
 
 
455 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  44.35 
 
 
482 aa  352  7e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  43.86 
 
 
445 aa  352  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  44.03 
 
 
472 aa  351  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  43.58 
 
 
463 aa  350  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  40.36 
 
 
453 aa  348  9e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  41.43 
 
 
489 aa  347  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  44 
 
 
457 aa  346  6e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  40.49 
 
 
458 aa  342  8e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  40.22 
 
 
463 aa  342  9e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  40.28 
 
 
450 aa  342  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  41.61 
 
 
440 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  41.84 
 
 
440 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  42.08 
 
 
444 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  41.08 
 
 
448 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  40.91 
 
 
479 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  40.04 
 
 
500 aa  336  3.9999999999999995e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  39.1 
 
 
470 aa  333  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  41.26 
 
 
494 aa  333  5e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3603  TonB-like  38.46 
 
 
461 aa  331  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70293  hitchhiker  0.00573623 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  40.54 
 
 
488 aa  330  3e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  39.73 
 
 
458 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>