More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1082 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  100 
 
 		 447 aa  924    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  59.6 
 
 		 454 aa  572  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  55.76 
 
 		 450 aa  528  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4868  beta-galactosidase  55.88 
 
 		 467 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  50.34 
 
 		 462 aa  491  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  53.05 
 
 		 451 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0657  beta-galactosidase  52.26 
 
 		 445 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.647462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  49.89 
 
 		 444 aa  436  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  47.54 
 
 		 458 aa  411  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  48.53 
 
 		 446 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  48.3 
 
 		 446 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  43.98 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  46.61 
 
 		 488 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  44.2 
 
 		 451 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  46.85 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  43.96 
 
 		 478 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  42.86 
 
 		 438 aa  381  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  47.39 
 
 		 448 aa  378  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  43.43 
 
 		 446 aa  381  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  44.03 
 
 		 478 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  41.61 
 
 		 487 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  43.31 
 
 		 439 aa  374  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  42.98 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  43.4 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  44.71 
 
 		 466 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  43.37 
 
 		 446 aa  372  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  43.62 
 
 		 478 aa  365  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  44.09 
 
 		 453 aa  363  3e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  43.44 
 
 		 467 aa  362  5.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  44.02 
 
 		 463 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  41.78 
 
 		 452 aa  362  9e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  42.83 
 
 		 472 aa  362  9e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  44.9 
 
 		 453 aa  360  3e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  42.6 
 
 		 453 aa  360  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  45.02 
 
 		 459 aa  359  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  41.61 
 
 		 474 aa  358  9e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  44.93 
 
 		 463 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  42.45 
 
 		 484 aa  356  5e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  44.67 
 
 		 447 aa  356  5e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  44.83 
 
 		 470 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  44.25 
 
 		 467 aa  355  7.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  44.69 
 
 		 474 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  41.94 
 
 		 474 aa  352  7e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  40.71 
 
 		 476 aa  350  3e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  42.92 
 
 		 472 aa  348  7e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  43.23 
 
 		 482 aa  348  1e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  41.93 
 
 		 462 aa  348  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  42.4 
 
 		 467 aa  346  6e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  45.06 
 
 		 440 aa  345  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  42.5 
 
 		 439 aa  344  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  43.1 
 
 		 470 aa  344  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  40.58 
 
 		 448 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  42.6 
 
 		 482 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  43.14 
 
 		 471 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  43.68 
 
 		 436 aa  340  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  44 
 
 		 472 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  41.81 
 
 		 494 aa  340  4e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  41.43 
 
 		 463 aa  339  5e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  43.05 
 
 		 449 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  41.69 
 
 		 456 aa  338  9.999999999999999e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  43.37 
 
 		 489 aa  336  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  40.04 
 
 		 491 aa  336  5e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  41.02 
 
 		 485 aa  333  3e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  41.13 
 
 		 488 aa  333  5e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  43.18 
 
 		 457 aa  332  6e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  43.13 
 
 		 466 aa  332  9e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  41.42 
 
 		 470 aa  331  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  42.7 
 
 		 455 aa  330  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  42.82 
 
 		 460 aa  330  3e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  42.06 
 
 		 500 aa  330  4e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  40.09 
 
 		 458 aa  330  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  38.67 
 
 		 447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  39.64 
 
 		 457 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  42.2 
 
 		 463 aa  324  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  41.44 
 
 		 465 aa  323  4e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  40.35 
 
 		 479 aa  323  5e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  39.95 
 
 		 450 aa  323  5e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  40.36 
 
 		 457 aa  322  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  40.87 
 
 		 444 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  42.6 
 
 		 437 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  40.68 
 
 		 458 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  39.05 
 
 		 482 aa  318  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  41.72 
 
 		 444 aa  317  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  40.76 
 
 		 517 aa  317  3e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  40.9 
 
 		 494 aa  317  4e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  41.31 
 
 		 458 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  40.45 
 
 		 458 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  40.77 
 
 		 452 aa  316  5e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  39.33 
 
 		 453 aa  316  6e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  39.77 
 
 		 444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  39.22 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  41.04 
 
 		 440 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  40.61 
 
 		 479 aa  312  7.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  39.08 
 
 		 443 aa  311  2e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  37.93 
 
 		 499 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  41.08 
 
 		 445 aa  311  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  38.53 
 
 		 451 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  38.99 
 
 		 473 aa  309  6.999999999999999e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  38.86 
 
 		 451 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  39.54 
 
 		 468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>