More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4868 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4868  beta-galactosidase  100 
 
 		 467 aa  966    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  58.24 
 
 		 454 aa  547  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  55.88 
 
 		 447 aa  530  1e-149  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  52 
 
 		 451 aa  511  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  52.71 
 
 		 450 aa  508  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0657  beta-galactosidase  52.6 
 
 		 445 aa  486  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.647462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  49.32 
 
 		 462 aa  481  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  46.7 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  45.27 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  42.6 
 
 		 456 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  43.27 
 
 		 478 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  43.57 
 
 		 446 aa  373  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  43.57 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  46.38 
 
 		 443 aa  375  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  43.5 
 
 		 471 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  43.04 
 
 		 487 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  44.08 
 
 		 478 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  42.95 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  44.71 
 
 		 482 aa  365  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  42.86 
 
 		 474 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  42.02 
 
 		 452 aa  363  2e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  41.76 
 
 		 446 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  43.2 
 
 		 472 aa  361  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  41.89 
 
 		 439 aa  360  3e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  40.53 
 
 		 476 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  42.83 
 
 		 478 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  45 
 
 		 472 aa  356  5e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  42.52 
 
 		 484 aa  355  1e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  41.19 
 
 		 467 aa  353  2.9999999999999997e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  41.18 
 
 		 453 aa  352  5.9999999999999994e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  42.73 
 
 		 482 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  41.4 
 
 		 438 aa  352  8.999999999999999e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  41.76 
 
 		 446 aa  350  3e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  42.2 
 
 		 458 aa  350  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  44.84 
 
 		 466 aa  348  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  41.97 
 
 		 491 aa  346  6e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  41.96 
 
 		 479 aa  343  5e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  41.98 
 
 		 500 aa  341  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  41.63 
 
 		 463 aa  340  4e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  41.91 
 
 		 517 aa  339  5e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  38.6 
 
 		 452 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  43.24 
 
 		 488 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  41.99 
 
 		 465 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  40.39 
 
 		 463 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  40.05 
 
 		 474 aa  336  5e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  41.49 
 
 		 494 aa  336  5e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  42.54 
 
 		 456 aa  335  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  40.72 
 
 		 447 aa  333  3e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  41.11 
 
 		 462 aa  333  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  41.31 
 
 		 467 aa  333  4e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  42.57 
 
 		 459 aa  332  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  41.02 
 
 		 485 aa  332  1e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  40.86 
 
 		 463 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  39.23 
 
 		 453 aa  330  3e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  40.13 
 
 		 448 aa  330  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  43.99 
 
 		 455 aa  329  7e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  40.41 
 
 		 470 aa  329  7e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  40.48 
 
 		 472 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  39.46 
 
 		 467 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  39.41 
 
 		 457 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  40.54 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  39.05 
 
 		 457 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  40.09 
 
 		 470 aa  323  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  39.25 
 
 		 470 aa  323  6e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  40.04 
 
 		 474 aa  320  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  42.21 
 
 		 445 aa  320  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  41.22 
 
 		 450 aa  319  7e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  40.72 
 
 		 488 aa  319  7e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  40.73 
 
 		 440 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  44.34 
 
 		 453 aa  317  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  41.11 
 
 		 471 aa  318  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  40 
 
 		 450 aa  317  3e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  40.27 
 
 		 440 aa  316  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  40.49 
 
 		 909 aa  316  7e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  40.22 
 
 		 473 aa  315  8e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  38.37 
 
 		 444 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  41.06 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  40.34 
 
 		 494 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  40.27 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  37.75 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  39.07 
 
 		 458 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  38.66 
 
 		 451 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  39.17 
 
 		 449 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  42.11 
 
 		 448 aa  313  4.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  40.18 
 
 		 479 aa  313  5.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  39.03 
 
 		 443 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  40.86 
 
 		 466 aa  313  5.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  39.63 
 
 		 446 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  38.78 
 
 		 453 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  40.09 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  38.3 
 
 		 451 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  38.19 
 
 		 451 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  38.93 
 
 		 452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  39.64 
 
 		 482 aa  307  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  37.96 
 
 		 451 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  38.16 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  42.13 
 
 		 437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  40.67 
 
 		 489 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  38.72 
 
 		 457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  41.61 
 
 		 436 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>