More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4857 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  100 
 
 
450 aa  934    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  55.76 
 
 
447 aa  540  9.999999999999999e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  55.91 
 
 
462 aa  536  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  52.71 
 
 
451 aa  518  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  53.02 
 
 
454 aa  509  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4868  beta-galactosidase  52.71 
 
 
467 aa  498  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0657  beta-galactosidase  52.26 
 
 
445 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.647462  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  44.8 
 
 
444 aa  414  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  44.24 
 
 
458 aa  403  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  43.79 
 
 
446 aa  395  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  43.79 
 
 
446 aa  396  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  44.22 
 
 
451 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  42.34 
 
 
471 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  41.12 
 
 
456 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  42.02 
 
 
446 aa  369  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  40.44 
 
 
478 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  42.08 
 
 
439 aa  369  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  40.38 
 
 
484 aa  368  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  43.15 
 
 
446 aa  362  9e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  40.31 
 
 
478 aa  360  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  37.88 
 
 
487 aa  358  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  39.46 
 
 
474 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  40.72 
 
 
443 aa  358  1.9999999999999998e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  40.63 
 
 
459 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  38.63 
 
 
476 aa  356  5e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  40.45 
 
 
452 aa  355  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  40.89 
 
 
448 aa  354  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  40.82 
 
 
438 aa  354  2e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  39.82 
 
 
478 aa  352  8.999999999999999e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  40.31 
 
 
482 aa  352  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  40.87 
 
 
453 aa  351  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  39.04 
 
 
457 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  40.41 
 
 
488 aa  347  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  40.18 
 
 
472 aa  346  6e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  43.52 
 
 
466 aa  345  7e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  39.91 
 
 
448 aa  342  7e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  38.74 
 
 
439 aa  342  8e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  39.39 
 
 
482 aa  341  2e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  38.48 
 
 
457 aa  338  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  40.18 
 
 
453 aa  338  9.999999999999999e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  38.57 
 
 
447 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  39.87 
 
 
472 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  40.04 
 
 
452 aa  336  5e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  39.1 
 
 
500 aa  336  5.999999999999999e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  37.39 
 
 
472 aa  335  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  39.21 
 
 
474 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  38.43 
 
 
467 aa  334  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  37.36 
 
 
467 aa  333  4e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  39.69 
 
 
465 aa  332  6e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  39.86 
 
 
444 aa  332  1e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  37.74 
 
 
470 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  37.77 
 
 
463 aa  330  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  40.86 
 
 
445 aa  329  5.0000000000000004e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  38.38 
 
 
462 aa  329  7e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  38.34 
 
 
474 aa  328  9e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  37.92 
 
 
485 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  38.25 
 
 
494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  39.63 
 
 
468 aa  326  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  38.51 
 
 
494 aa  326  5e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  39.24 
 
 
453 aa  326  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  38.89 
 
 
470 aa  326  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  39.77 
 
 
450 aa  325  7e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  38.71 
 
 
440 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  37.58 
 
 
443 aa  325  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  38.03 
 
 
457 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  38 
 
 
453 aa  323  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  39.47 
 
 
449 aa  323  3e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  38.64 
 
 
443 aa  323  4e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  38.39 
 
 
463 aa  323  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  38.48 
 
 
440 aa  322  8e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  39.52 
 
 
479 aa  321  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  36.64 
 
 
467 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  38.79 
 
 
446 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  38.53 
 
 
447 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  39.82 
 
 
457 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  38.62 
 
 
470 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  38.48 
 
 
451 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  38.48 
 
 
451 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  40.37 
 
 
436 aa  320  5e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  38.48 
 
 
451 aa  319  7e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  39.09 
 
 
460 aa  319  7.999999999999999e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  38.69 
 
 
450 aa  318  9e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  35.19 
 
 
458 aa  316  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  36.12 
 
 
463 aa  316  5e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  38.02 
 
 
451 aa  315  9e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  38.67 
 
 
473 aa  315  9e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  38.5 
 
 
443 aa  315  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  37.37 
 
 
466 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  37.5 
 
 
489 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  36.85 
 
 
499 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  38.39 
 
 
482 aa  313  3.9999999999999997e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  38.27 
 
 
450 aa  312  6.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  34.89 
 
 
491 aa  311  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  38.31 
 
 
488 aa  311  2e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  37.47 
 
 
440 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  37.14 
 
 
471 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  36.83 
 
 
517 aa  309  5e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  38.48 
 
 
444 aa  309  5e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  39.26 
 
 
437 aa  309  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  37.93 
 
 
444 aa  308  9e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>