More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4320 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  100 
 
 		 460 aa  947    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  72.05 
 
 		 440 aa  676    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  72.12 
 
 		 470 aa  695    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  70.29 
 
 		 463 aa  669    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  53.33 
 
 		 447 aa  494  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  52.68 
 
 		 443 aa  485  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  52.9 
 
 		 443 aa  481  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  54.83 
 
 		 452 aa  481  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  51.01 
 
 		 451 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  50.56 
 
 		 451 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  51.01 
 
 		 446 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  50.56 
 
 		 451 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  50.56 
 
 		 451 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  49.67 
 
 		 449 aa  462  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  50.89 
 
 		 444 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  48.42 
 
 		 443 aa  449  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  55.7 
 
 		 443 aa  449  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  49.33 
 
 		 452 aa  434  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  51.6 
 
 		 448 aa  427  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  50.8 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  50 
 
 		 444 aa  412  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  50.77 
 
 		 478 aa  411  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  46.41 
 
 		 451 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  50 
 
 		 484 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  49.32 
 
 		 456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  49.46 
 
 		 472 aa  405  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  51.6 
 
 		 448 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  45.8 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  51.22 
 
 		 472 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  49.32 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  49.66 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  52.54 
 
 		 459 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  50.79 
 
 		 467 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  46.72 
 
 		 487 aa  396  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  47.51 
 
 		 474 aa  396  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  45.16 
 
 		 439 aa  395  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  46.9 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  48.16 
 
 		 476 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  46.25 
 
 		 478 aa  391  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  49.25 
 
 		 478 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  51.6 
 
 		 453 aa  388  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  48.46 
 
 		 462 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  48.74 
 
 		 452 aa  382  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  49.12 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  50.43 
 
 		 482 aa  381  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  48.66 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  50.93 
 
 		 455 aa  379  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  43.46 
 
 		 452 aa  376  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  49.89 
 
 		 447 aa  376  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  47.72 
 
 		 488 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  49.09 
 
 		 453 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  49.23 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  47.11 
 
 		 457 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  46.14 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  47.81 
 
 		 439 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  47.12 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  50.82 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  46.55 
 
 		 474 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  50.22 
 
 		 474 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  45.45 
 
 		 457 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  52.19 
 
 		 463 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  50.68 
 
 		 437 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  48.68 
 
 		 482 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  46.26 
 
 		 485 aa  368  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  42.31 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  48.93 
 
 		 472 aa  368  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  46.09 
 
 		 456 aa  363  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  48.06 
 
 		 470 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  47.07 
 
 		 467 aa  363  4e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  46.24 
 
 		 491 aa  362  5.0000000000000005e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  47.07 
 
 		 450 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  45.23 
 
 		 494 aa  362  9e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  48.98 
 
 		 457 aa  362  9e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  45.4 
 
 		 517 aa  361  1e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  48.71 
 
 		 494 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  47.07 
 
 		 466 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  43.02 
 
 		 446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  48.9 
 
 		 479 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  43.42 
 
 		 446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  47.07 
 
 		 440 aa  356  5e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  47.75 
 
 		 445 aa  353  5e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  46 
 
 		 440 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  46.44 
 
 		 489 aa  350  4e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  46.48 
 
 		 435 aa  349  5e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  0.0000345699 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  42.69 
 
 		 446 aa  349  6e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  45.12 
 
 		 448 aa  347  2e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  45.59 
 
 		 463 aa  347  4e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1146  Beta-glucosidase  46.26 
 
 		 440 aa  346  5e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  43.96 
 
 		 444 aa  346  6e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  47.8 
 
 		 466 aa  344  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  42.82 
 
 		 447 aa  343  2.9999999999999997e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  44.74 
 
 		 463 aa  342  7e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3917  Beta-glucosidase  47.24 
 
 		 455 aa  341  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  47.87 
 
 		 444 aa  340  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  45.95 
 
 		 468 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  45 
 
 		 465 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  40.55 
 
 		 470 aa  333  5e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4086  beta-galactosidase  45.47 
 
 		 486 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1944  Beta-glucosidase  45.01 
 
 		 433 aa  329  6e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  40.18 
 
 		 450 aa  327  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>