More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3445 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  100 
 
 
499 aa  1012    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  57.29 
 
 
473 aa  566  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  57.44 
 
 
479 aa  565  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  49.67 
 
 
436 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  47.02 
 
 
447 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  48.82 
 
 
445 aa  421  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  47 
 
 
465 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  49.78 
 
 
437 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  47.75 
 
 
459 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  44.75 
 
 
467 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  44.95 
 
 
453 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  48.09 
 
 
444 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  43.42 
 
 
467 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  45.92 
 
 
488 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  42.62 
 
 
462 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  45.74 
 
 
458 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  41.45 
 
 
446 aa  372  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  44.56 
 
 
478 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  41.79 
 
 
451 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  43.33 
 
 
463 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  43.72 
 
 
478 aa  366  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  46.68 
 
 
472 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  41.81 
 
 
438 aa  362  8e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  43.48 
 
 
487 aa  360  3e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  42.34 
 
 
453 aa  358  9.999999999999999e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  44.44 
 
 
467 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  44.07 
 
 
472 aa  355  7.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  44.24 
 
 
489 aa  355  1e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  42.16 
 
 
468 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  42.65 
 
 
476 aa  352  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  42.25 
 
 
444 aa  348  2e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  42.04 
 
 
484 aa  347  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  42.4 
 
 
474 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  40.17 
 
 
471 aa  345  8e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  42.56 
 
 
472 aa  345  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  43.92 
 
 
463 aa  343  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  44.35 
 
 
470 aa  343  4e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  45.05 
 
 
478 aa  342  7e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  40.65 
 
 
458 aa  342  9e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0033  beta-galactosidase  44.21 
 
 
420 aa  342  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  42.23 
 
 
485 aa  341  1e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  39.44 
 
 
439 aa  341  2e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  41.44 
 
 
457 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  43.51 
 
 
482 aa  340  5e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  43.53 
 
 
443 aa  339  5.9999999999999996e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  41.3 
 
 
474 aa  338  9e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  41.38 
 
 
494 aa  338  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  41.1 
 
 
457 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  42.65 
 
 
466 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  38.74 
 
 
474 aa  335  9e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  40.85 
 
 
448 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  43.22 
 
 
482 aa  334  3e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  40.3 
 
 
450 aa  333  6e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  36.74 
 
 
452 aa  331  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  39.36 
 
 
446 aa  331  2e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  39.11 
 
 
446 aa  331  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  43.21 
 
 
455 aa  330  4e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  39.66 
 
 
468 aa  329  6e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  41.98 
 
 
479 aa  329  7e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  43.78 
 
 
466 aa  328  9e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  40.35 
 
 
456 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  38.2 
 
 
470 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  39.06 
 
 
909 aa  327  4.0000000000000003e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  37.58 
 
 
447 aa  326  5e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  38.92 
 
 
453 aa  325  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  44.28 
 
 
457 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  39.46 
 
 
458 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  40.84 
 
 
452 aa  323  4e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  39.43 
 
 
450 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  39.67 
 
 
470 aa  322  9.000000000000001e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  39.83 
 
 
457 aa  322  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  39.1 
 
 
446 aa  322  9.999999999999999e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  38.1 
 
 
458 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  39.58 
 
 
458 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  43.22 
 
 
494 aa  320  3e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3917  Beta-glucosidase  41.16 
 
 
455 aa  319  6e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  41.74 
 
 
482 aa  319  9e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  41.56 
 
 
471 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0705  6-phospho-beta-glucosidase  36.16 
 
 
469 aa  318  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76639  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  41.46 
 
 
491 aa  317  4e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  41.25 
 
 
500 aa  317  4e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  36.02 
 
 
469 aa  316  5e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  39.24 
 
 
463 aa  317  5e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  38.14 
 
 
463 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  40.6 
 
 
440 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  41.3 
 
 
448 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  40.49 
 
 
517 aa  314  2.9999999999999996e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  37.04 
 
 
440 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  37.61 
 
 
443 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  39.96 
 
 
440 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  37.64 
 
 
449 aa  312  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  37.93 
 
 
447 aa  311  1e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  42.64 
 
 
453 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  37.47 
 
 
446 aa  310  5e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  37.32 
 
 
444 aa  310  5e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0575  glycoside hydrolase family 1  42.33 
 
 
446 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3061  beta-galactosidase  40.62 
 
 
456 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3603  TonB-like  39.1 
 
 
461 aa  307  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70293  hitchhiker  0.00573623 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  39.79 
 
 
448 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  36.85 
 
 
450 aa  306  6e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>