More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3603 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3603  TonB-like  100 
 
 		 461 aa  966    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70293  hitchhiker  0.00573623 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  48.91 
 
 		 909 aa  460  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  46.32 
 
 		 446 aa  406  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10124  beta-glucosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14710)  46.14 
 
 		 483 aa  398  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0847902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  44.52 
 
 		 458 aa  398  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  43.79 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  43.51 
 
 		 446 aa  391  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  45.59 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10375  beta-glucosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12600)  44.8 
 
 		 486 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  43.3 
 
 		 444 aa  382  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  42.6 
 
 		 439 aa  366  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  43.48 
 
 		 446 aa  364  2e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  41.7 
 
 		 450 aa  363  3e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  40.91 
 
 		 471 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  41.39 
 
 		 451 aa  362  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  41.56 
 
 		 452 aa  361  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  41.56 
 
 		 467 aa  361  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  42.67 
 
 		 484 aa  355  8.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  42.79 
 
 		 453 aa  353  4e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  41.29 
 
 		 478 aa  353  5e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  41.25 
 
 		 474 aa  351  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  41.92 
 
 		 448 aa  348  9e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  39.7 
 
 		 474 aa  345  8e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  41.68 
 
 		 476 aa  345  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  41.54 
 
 		 467 aa  345  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  42.95 
 
 		 436 aa  344  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0705  6-phospho-beta-glucosidase  41.7 
 
 		 469 aa  344  2e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76639  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  41.01 
 
 		 467 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  42.17 
 
 		 448 aa  342  5.999999999999999e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  40.13 
 
 		 465 aa  342  7e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  40.04 
 
 		 443 aa  342  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  42.55 
 
 		 459 aa  342  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  42.46 
 
 		 478 aa  342  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  42.11 
 
 		 457 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  42.76 
 
 		 472 aa  340  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  39.57 
 
 		 467 aa  338  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  39.61 
 
 		 448 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  40.53 
 
 		 450 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  41.33 
 
 		 457 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  38.91 
 
 		 445 aa  334  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  40 
 
 		 453 aa  333  4e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  40.88 
 
 		 457 aa  333  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  41.38 
 
 		 472 aa  333  5e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  40.3 
 
 		 478 aa  332  9e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  38.46 
 
 		 447 aa  331  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  38.24 
 
 		 456 aa  330  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  39.65 
 
 		 462 aa  330  4e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  38.44 
 
 		 452 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  39.78 
 
 		 458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  40.04 
 
 		 466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  39.61 
 
 		 487 aa  327  2.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  41.01 
 
 		 453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  41.19 
 
 		 489 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  41.89 
 
 		 468 aa  327  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  41.04 
 
 		 466 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  38.91 
 
 		 500 aa  326  6e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  40.43 
 
 		 447 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  38.86 
 
 		 449 aa  325  9e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  39.53 
 
 		 494 aa  324  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  40.53 
 
 		 437 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  38.81 
 
 		 479 aa  323  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  41.19 
 
 		 469 aa  322  8e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  39.02 
 
 		 470 aa  321  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  38.68 
 
 		 453 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  40.22 
 
 		 468 aa  320  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  39.91 
 
 		 458 aa  319  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  40.17 
 
 		 482 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  41.43 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  39.87 
 
 		 479 aa  318  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  40.22 
 
 		 452 aa  317  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  40.42 
 
 		 488 aa  317  3e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  40.59 
 
 		 482 aa  317  3e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  39.48 
 
 		 488 aa  316  4e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  39.92 
 
 		 517 aa  315  7e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  39.6 
 
 		 470 aa  316  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  40.13 
 
 		 478 aa  315  8e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  39.78 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  39.96 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  38.44 
 
 		 473 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  37.58 
 
 		 494 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  37.92 
 
 		 444 aa  315  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  39.83 
 
 		 491 aa  312  6.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  39.91 
 
 		 485 aa  310  2e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  39.07 
 
 		 440 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  40 
 
 		 450 aa  311  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  37.09 
 
 		 458 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  38.06 
 
 		 465 aa  309  6.999999999999999e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  39.48 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  37.78 
 
 		 451 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  39.1 
 
 		 499 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  37.56 
 
 		 451 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  37.33 
 
 		 451 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  37.56 
 
 		 451 aa  306  7e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  38.46 
 
 		 443 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  39.74 
 
 		 444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  40.04 
 
 		 474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  39.24 
 
 		 478 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  38.7 
 
 		 472 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  37.42 
 
 		 470 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  40.48 
 
 		 463 aa  303  6.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>