More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3917 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3917  Beta-glucosidase  100 
 
 
455 aa  899    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  53.67 
 
 
459 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  51.4 
 
 
467 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  54.46 
 
 
437 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  50.56 
 
 
488 aa  403  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  49.67 
 
 
472 aa  402  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  51.19 
 
 
466 aa  401  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  50.33 
 
 
458 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  50.78 
 
 
436 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  49.78 
 
 
444 aa  395  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  48.01 
 
 
465 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  49.56 
 
 
453 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  49.45 
 
 
472 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  48.47 
 
 
467 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  47.23 
 
 
453 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  46.48 
 
 
474 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  48.69 
 
 
478 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  47.95 
 
 
462 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  46.44 
 
 
478 aa  382  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  42.29 
 
 
446 aa  383  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  44.96 
 
 
474 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  47.02 
 
 
467 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  49.78 
 
 
482 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  48.3 
 
 
494 aa  376  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  49.89 
 
 
482 aa  375  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  43.49 
 
 
451 aa  373  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  49.34 
 
 
463 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  47.08 
 
 
484 aa  373  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  47.2 
 
 
491 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  48.13 
 
 
489 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  45.83 
 
 
452 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  47.63 
 
 
487 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  41.91 
 
 
471 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  48.24 
 
 
479 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  45.73 
 
 
476 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  52.09 
 
 
472 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  47.68 
 
 
447 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  48.35 
 
 
471 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  49.13 
 
 
478 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  51.61 
 
 
463 aa  365  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  44.03 
 
 
451 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  46.68 
 
 
458 aa  364  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  43.81 
 
 
451 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  46.05 
 
 
485 aa  362  6e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  43.81 
 
 
451 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  49.89 
 
 
443 aa  361  1e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  47.25 
 
 
468 aa  362  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  50 
 
 
444 aa  361  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  49.23 
 
 
470 aa  361  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  49.02 
 
 
474 aa  361  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  42.95 
 
 
443 aa  359  7e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  48.13 
 
 
445 aa  358  8e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  47.56 
 
 
494 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  45.63 
 
 
456 aa  358  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  43.61 
 
 
451 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  47.88 
 
 
500 aa  356  3.9999999999999996e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  44.62 
 
 
443 aa  355  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  46.05 
 
 
468 aa  354  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  46.15 
 
 
463 aa  354  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  43.61 
 
 
447 aa  354  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  47.23 
 
 
440 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  42.26 
 
 
446 aa  350  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  45.31 
 
 
439 aa  350  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  42.35 
 
 
446 aa  350  2e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  47.88 
 
 
517 aa  350  3e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  47.23 
 
 
440 aa  349  5e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  49.56 
 
 
466 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  47.54 
 
 
455 aa  347  4e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  45.35 
 
 
448 aa  346  5e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  38.88 
 
 
452 aa  345  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  43.78 
 
 
457 aa  343  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  44.44 
 
 
457 aa  343  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  45.11 
 
 
457 aa  342  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  44.32 
 
 
450 aa  340  2e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  42.08 
 
 
449 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  43.36 
 
 
446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  42.51 
 
 
443 aa  339  5e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  48.32 
 
 
457 aa  338  8e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  45.67 
 
 
488 aa  338  9.999999999999999e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  40.13 
 
 
439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  45.45 
 
 
453 aa  336  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  44.72 
 
 
456 aa  336  5e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  44.79 
 
 
448 aa  336  5.999999999999999e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  43.56 
 
 
470 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  40.72 
 
 
438 aa  335  1e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  44.07 
 
 
435 aa  333  3e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  0.0000345699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  44.44 
 
 
440 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  45.82 
 
 
463 aa  333  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  44.59 
 
 
482 aa  333  5e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  42.83 
 
 
479 aa  332  7.000000000000001e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  42.89 
 
 
458 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  41.04 
 
 
444 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  42.76 
 
 
452 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  42.41 
 
 
458 aa  325  9e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  43.69 
 
 
444 aa  324  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  43.33 
 
 
458 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  42.22 
 
 
473 aa  322  8e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  44.04 
 
 
450 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  41.16 
 
 
499 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1944  Beta-glucosidase  44.07 
 
 
433 aa  320  5e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>