More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2295 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2609  glycosy hydrolase family protein  98.47 
 
 		 459 aa  934    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2295  beta-glucosidase a  100 
 
 		 459 aa  944    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1473  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  57.7 
 
 		 475 aa  575  1.0000000000000001e-163  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.27545  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0682  glycoside hydrolase family 1  57.39 
 
 		 461 aa  565  1e-160  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1586  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  57.45 
 
 		 479 aa  561  1.0000000000000001e-159  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.816968  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4095  glycoside hydrolase family 1  56.43 
 
 		 469 aa  541  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.362343  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0836  Beta-glucosidase  53.9 
 
 		 461 aa  541  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0202  Beta-glucosidase  56.33 
 
 		 459 aa  535  1e-151  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2667  Beta-glucosidase  54.76 
 
 		 470 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0267  Beta-glucosidase  57.11 
 
 		 464 aa  529  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3120  Beta-glucosidase  53.26 
 
 		 460 aa  520  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.29426  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0035  Beta-glucosidase  51.52 
 
 		 465 aa  502  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4171  beta-glucosidase  52.16 
 
 		 460 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663192  normal  0.656643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4055  beta-glucosidase  51.95 
 
 		 460 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  0.0647863 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4106  beta-glucosidase  52.16 
 
 		 460 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4001  beta-glucosidase  51.95 
 
 		 460 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3983  beta-glucosidase  51.95 
 
 		 460 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0030  Beta-glucosidase  51.3 
 
 		 470 aa  501  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0153  Beta-glucosidase  54.27 
 
 		 457 aa  499  1e-140  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0036  Beta-glucosidase  51.52 
 
 		 462 aa  494  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2997  Beta-glucosidase  50.54 
 
 		 461 aa  476  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585051  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3201  Beta-glucosidase  48.7 
 
 		 470 aa  457  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.281249  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0757  glycoside hydrolase family 1  45.08 
 
 		 478 aa  422  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.778276  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0737  glycoside hydrolase family 1  44.86 
 
 		 478 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3468  glycoside hydrolase family 1  43.98 
 
 		 478 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3281  glycoside hydrolase family protein  42.51 
 
 		 475 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.69371  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl425  beta-glucosidase  41.41 
 
 		 452 aa  366  1e-100  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00336379  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0078  glycoside hydrolase family 1  39.19 
 
 		 465 aa  358  9.999999999999999e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  34.33 
 
 		 467 aa  294  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  37.02 
 
 		 468 aa  285  9e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000864556  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  38.56 
 
 		 469 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  34.56 
 
 		 471 aa  278  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  34.29 
 
 		 451 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  34.13 
 
 		 446 aa  268  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0705  6-phospho-beta-glucosidase  37.68 
 
 		 469 aa  265  8.999999999999999e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76639  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  34.33 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  35.15 
 
 		 446 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  32.06 
 
 		 465 aa  260  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  33.26 
 
 		 474 aa  260  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  34.72 
 
 		 446 aa  259  7e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  33.19 
 
 		 463 aa  259  8e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  34.92 
 
 		 446 aa  256  5e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  34.6 
 
 		 478 aa  256  8e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  32.53 
 
 		 453 aa  253  5.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  34.51 
 
 		 438 aa  250  4e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0345  6-phospho-beta-glucosidase  32.77 
 
 		 455 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  32.35 
 
 		 452 aa  246  8e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  33.33 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  32.56 
 
 		 478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  32.71 
 
 		 475 aa  244  3e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  32.08 
 
 		 457 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  31.86 
 
 		 458 aa  242  9e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  32.89 
 
 		 439 aa  242  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  33.12 
 
 		 478 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0344  6-phospho-beta-galactosidase  32.91 
 
 		 484 aa  241  2e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000215907  hitchhiker  0.000984044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  30.84 
 
 		 457 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  31.81 
 
 		 459 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2220  6-phospho-beta-galactosidase  32.03 
 
 		 470 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2259  6-phospho-beta-galactosidase  32.03 
 
 		 470 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  31.81 
 
 		 909 aa  231  2e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  30.56 
 
 		 478 aa  230  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  31.25 
 
 		 452 aa  230  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  31.3 
 
 		 439 aa  229  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  30.09 
 
 		 467 aa  229  8e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  30.89 
 
 		 443 aa  228  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  30.32 
 
 		 451 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  30.04 
 
 		 476 aa  226  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  31.71 
 
 		 449 aa  226  7e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  30.11 
 
 		 451 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  30.11 
 
 		 451 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1789  6-phospho-beta-galactosidase  31.62 
 
 		 470 aa  224  4e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  30.89 
 
 		 470 aa  224  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  29.89 
 
 		 451 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  30.85 
 
 		 478 aa  223  7e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D39  6-phospho-beta-galactosidase  31.9 
 
 		 468 aa  222  9.999999999999999e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  31.24 
 
 		 488 aa  222  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  30.77 
 
 		 478 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  28.88 
 
 		 489 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0743  Beta-glucosidase  32.56 
 
 		 475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl011  beta-glucosidase  32.14 
 
 		 464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  30.28 
 
 		 467 aa  219  7.999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  30.98 
 
 		 474 aa  219  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  30.67 
 
 		 494 aa  218  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3901  glycoside hydrolase family 1  31.58 
 
 		 479 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00796853  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  30.67 
 
 		 444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  30.52 
 
 		 517 aa  217  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  27.33 
 
 		 487 aa  216  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3044  beta-glucosidase  30.15 
 
 		 461 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  30.28 
 
 		 448 aa  216  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  30.36 
 
 		 472 aa  216  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  32.09 
 
 		 474 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl617  6-phospho-beta-glucosidase  31.6 
 
 		 466 aa  215  9.999999999999999e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  31.2 
 
 		 484 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3481  glycoside hydrolase family 1  31.88 
 
 		 470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  29.71 
 
 		 448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  30.6 
 
 		 443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0979  Beta-glucosidase  31.71 
 
 		 475 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  29.74 
 
 		 446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  29.44 
 
 		 488 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1165  6-phospho-beta-glucosidase  30.36 
 
 		 478 aa  214  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>