105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4332 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  100 
 
 		 615 aa  1261    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2185  beta and gamma crystallin  45.19 
 
 		 483 aa  332  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421381  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  50.21 
 
 		 884 aa  235  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  49.38 
 
 		 957 aa  231  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  37.96 
 
 		 1187 aa  211  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1713  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  40.29 
 
 		 454 aa  173  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  35.53 
 
 		 1141 aa  140  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  42.86 
 
 		 1139 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  45.65 
 
 		 401 aa  107  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  33.19 
 
 		 1259 aa  107  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  28.66 
 
 		 726 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  40.15 
 
 		 563 aa  103  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  39.58 
 
 		 491 aa  97.1  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  39.86 
 
 		 503 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  40.94 
 
 		 425 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  40 
 
 		 691 aa  95.9  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  41.01 
 
 		 430 aa  96.3  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  43.28 
 
 		 411 aa  94.4  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  41.67 
 
 		 569 aa  93.6  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5733  S1D (lysyl endopeptidase) subfamily C-terminal domain protein  33.64 
 
 		 349 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  35.97 
 
 		 1413 aa  91.3  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  25.72 
 
 		 613 aa  90.5  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.68 
 
 		 507 aa  89.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.31 
 
 		 474 aa  89.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  37.68 
 
 		 672 aa  89  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  38.06 
 
 		 392 aa  87  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.74 
 
 		 695 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  34.85 
 
 		 571 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  38.06 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  38.41 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  32.67 
 
 		 472 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  36.5 
 
 		 863 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  35.16 
 
 		 483 aa  80.9  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.96 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  34.04 
 
 		 436 aa  79.7  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  36.5 
 
 		 982 aa  78.2  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.82 
 
 		 514 aa  77.4  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  36.43 
 
 		 537 aa  77.4  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  33.6 
 
 		 789 aa  77  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  37.59 
 
 		 582 aa  77  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.51 
 
 		 466 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  35.25 
 
 		 494 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2188  peptidase domain protein  49.33 
 
 		 692 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000255141  hitchhiker  0.000237212 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  32.88 
 
 		 503 aa  75.1  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  34.31 
 
 		 566 aa  74.7  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2581  hypothetical protein  40.86 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000219453  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.58 
 
 		 507 aa  73.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  41.28 
 
 		 465 aa  72  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  32.09 
 
 		 897 aa  70.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  25.25 
 
 		 2073 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.08 
 
 		 507 aa  70.5  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.83 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  31.91 
 
 		 497 aa  70.1  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3094  beta and gamma crystallin  46.91 
 
 		 450 aa  70.5  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  39.78 
 
 		 560 aa  69.3  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  33.33 
 
 		 510 aa  67.8  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  33.33 
 
 		 445 aa  67  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  32.86 
 
 		 618 aa  66.6  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.86 
 
 		 756 aa  65.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  33.16 
 
 		 737 aa  65.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  33.83 
 
 		 647 aa  65.1  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  29.34 
 
 		 963 aa  63.9  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  36.9 
 
 		 955 aa  63.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  30.37 
 
 		 230 aa  62.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  29.85 
 
 		 943 aa  61.6  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  32.09 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  36.84 
 
 		 541 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  29.06 
 
 		 771 aa  60.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  25.87 
 
 		 487 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0902  hypothetical protein  30.66 
 
 		 545 aa  58.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.440975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  33.11 
 
 		 576 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  34.48 
 
 		 663 aa  57.4  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 489 aa  55.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.95 
 
 		 507 aa  55.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  35.71 
 
 		 717 aa  54.7  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  30.28 
 
 		 824 aa  54.3  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  27.15 
 
 		 664 aa  54.3  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  28.78 
 
 		 487 aa  53.9  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  33.66 
 
 		 239 aa  52  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3068  Ricin B lectin  31.07 
 
 		 489 aa  52  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 1049 aa  51.2  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  29.77 
 
 		 492 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0980  hypothetical protein  31.43 
 
 		 859 aa  50.8  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.266991 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  31.21 
 
 		 644 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  33.91 
 
 		 1016 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.35 
 
 		 648 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  34.78 
 
 		 482 aa  47.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1748  Ricin B lectin  42.22 
 
 		 1347 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207372  normal  0.0116173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  36.05 
 
 		 468 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0547  hypothetical protein  32.39 
 
 		 112 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  31.68 
 
 		 240 aa  46.2  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  28.24 
 
 		 368 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  33.01 
 
 		 748 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1414  hypothetical protein  29.7 
 
 		 1292 aa  45.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2725  glycoside hydrolase family 76  29.29 
 
 		 535 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  27.78 
 
 		 1172 aa  45.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  34.88 
 
 		 373 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0423  hypothetical protein  29.75 
 
 		 806 aa  44.7  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0374953  normal  0.0190212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  32.46 
 
 		 603 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  35.06 
 
 		 1302 aa  44.3  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>