24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2581 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2581  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  1001    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000219453  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0344  hypothetical protein  60.97 
 
 		 310 aa  352  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  48.18 
 
 		 861 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5837  hypothetical protein  47.9 
 
 		 313 aa  280  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.906773 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  48.45 
 
 		 1115 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2185  beta and gamma crystallin  32.83 
 
 		 483 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421381  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  34.5 
 
 		 613 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  48.19 
 
 		 884 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2188  peptidase domain protein  32.18 
 
 		 692 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000255141  hitchhiker  0.000237212 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  43.18 
 
 		 957 aa  84.7  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  43.75 
 
 		 726 aa  83.2  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  46.43 
 
 		 1187 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  37.14 
 
 		 1141 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  40.86 
 
 		 615 aa  73.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3094  beta and gamma crystallin  45.78 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  39.8 
 
 		 465 aa  70.1  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  39.02 
 
 		 955 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1414  hypothetical protein  34.44 
 
 		 1292 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  37.35 
 
 		 664 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0616  parallel beta-helix repeat-containing protein  46 
 
 		 20646 aa  49.3  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2248  hypothetical protein  33.77 
 
 		 549 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0788  hypothetical protein  34.94 
 
 		 248 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  27.55 
 
 		 749 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2114  hypothetical protein  27.5 
 
 		 549 aa  45.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.204968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>