41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2185 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2185  beta and gamma crystallin  100 
 
 		 483 aa  990    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421381  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  45.88 
 
 		 615 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1713  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  39.46 
 
 		 454 aa  184  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  50 
 
 		 613 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  49.23 
 
 		 726 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2188  peptidase domain protein  37.62 
 
 		 692 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000255141  hitchhiker  0.000237212 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2581  hypothetical protein  32.83 
 
 		 484 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000219453  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  53.93 
 
 		 957 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  42.97 
 
 		 884 aa  94.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5733  S1D (lysyl endopeptidase) subfamily C-terminal domain protein  28.25 
 
 		 349 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3094  beta and gamma crystallin  35.33 
 
 		 450 aa  87.8  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  48.28 
 
 		 1187 aa  83.6  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  32.09 
 
 		 1141 aa  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  32.34 
 
 		 465 aa  76.6  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  41.46 
 
 		 955 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1414  hypothetical protein  31.61 
 
 		 1292 aa  60.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  36 
 
 		 536 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 1332 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  32.88 
 
 		 1441 aa  54.3  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0922  hypothetical protein  30.28 
 
 		 730 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0622402  normal  0.970472 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  35.48 
 
 		 664 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0902  hypothetical protein  34.44 
 
 		 545 aa  51.6  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.440975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  34.67 
 
 		 924 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  32.26 
 
 		 919 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  31.51 
 
 		 394 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 491 aa  47.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  25.86 
 
 		 2239 aa  47  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  35.23 
 
 		 655 aa  47  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02230  metalloprotease, putative  26.32 
 
 		 927 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493351  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  28.3 
 
 		 752 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  30 
 
 		 1275 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  25.68 
 
 		 1346 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3974  hypothetical protein  30.85 
 
 		 186 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0326634  normal  0.332513 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  29.47 
 
 		 541 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  26.73 
 
 		 1002 aa  45.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2650  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1194 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  28.17 
 
 		 1748 aa  44.3  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1456  hypothetical protein  29.73 
 
 		 1024 aa  43.5  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00611896  normal  0.0757666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  26.73 
 
 		 1247 aa  43.5  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  31.71 
 
 		 1023 aa  43.5  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0788  hypothetical protein  32.38 
 
 		 248 aa  43.1  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>