31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2248 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2248  hypothetical protein  100 
 
 		 549 aa  1130    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0028  hypothetical protein  49.07 
 
 		 543 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000206462  normal  0.317386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2561  hypothetical protein  29.58 
 
 		 540 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.545295 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  36 
 
 		 669 aa  57  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  33.75 
 
 		 725 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  23.91 
 
 		 887 aa  51.6  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6786  hypothetical protein  28.74 
 
 		 707 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  34.09 
 
 		 774 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05870  hypothetical protein  28.12 
 
 		 243 aa  50.8  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0049  hypothetical protein  31.17 
 
 		 1449 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000651101  normal  0.0482632 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03270  hypothetical protein  34.83 
 
 		 1070 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.88849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2581  hypothetical protein  33.77 
 
 		 484 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000219453  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0490  hypothetical protein  36 
 
 		 691 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79487  normal  0.17216 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  32.91 
 
 		 1063 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  31.76 
 
 		 749 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  25.23 
 
 		 1187 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2477  hypothetical protein  35.96 
 
 		 1414 aa  47.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1427  thiol protease/hemagglutinin PrtT precursor, putative  25.89 
 
 		 843 aa  47.4  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.491886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1611  hypothetical protein  32.58 
 
 		 166 aa  47  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10753  putative membrane-anchored cell surface protein  31.37 
 
 		 827 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  31.33 
 
 		 752 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  34.78 
 
 		 801 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1969 aa  45.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  26.52 
 
 		 874 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05520  hypothetical protein  27.5 
 
 		 742 aa  44.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2524  subtilisin-like serine protease  30.56 
 
 		 1116 aa  44.3  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  26.32 
 
 		 788 aa  44.3  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.78 
 
 		 1343 aa  43.9  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  25.71 
 
 		 461 aa  43.9  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4317  hypothetical protein  31.76 
 
 		 620 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1303 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>