84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0334 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 861 aa  1754    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0344  hypothetical protein  51.33 
 
 		 310 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2581  hypothetical protein  48.18 
 
 		 484 aa  285  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000219453  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5837  hypothetical protein  47.92 
 
 		 313 aa  258  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.906773 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1786  hypothetical protein  46.43 
 
 		 475 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  41.42 
 
 		 1422 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  30.43 
 
 		 1322 aa  120  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  40.24 
 
 		 1427 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.35 
 
 		 834 aa  107  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  43.28 
 
 		 1426 aa  103  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5834  PKD domain-containing protein  41.6 
 
 		 206 aa  93.6  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.552498  normal  0.42039 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0123  coagulation factor 5/8 type-like  45.92 
 
 		 944 aa  91.3  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4279  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4  36.92 
 
 		 718 aa  89.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2646  PKD domain-containing protein  34.44 
 
 		 540 aa  86.3  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  47.11 
 
 		 480 aa  86.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3437  PKD domain containing protein  40.18 
 
 		 487 aa  83.2  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.639471  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0296  coagulation factor 5/8 type protein  43.75 
 
 		 954 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.464689  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2654  PKD domain-containing protein  32.54 
 
 		 690 aa  79.7  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  34.46 
 
 		 1363 aa  75.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  35.59 
 
 		 1363 aa  71.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  33.33 
 
 		 1380 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  41.24 
 
 		 340 aa  70.1  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  40 
 
 		 3507 aa  67  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2651  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4  29.32 
 
 		 506 aa  65.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.144451  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  31.75 
 
 		 1042 aa  65.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1084  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.46 
 
 		 675 aa  65.1  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00047148  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  24.74 
 
 		 1973 aa  64.3  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  37.96 
 
 		 4433 aa  63.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  30.43 
 
 		 527 aa  63.5  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  37.84 
 
 		 995 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  40.51 
 
 		 776 aa  60.8  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0088  multicopper oxidase type 2  32.34 
 
 		 1299 aa  60.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516794  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  28.72 
 
 		 841 aa  59.3  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  26.7 
 
 		 9585 aa  58.5  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  41.33 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  33.56 
 
 		 2068 aa  58.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0121  hypothetical protein  30.08 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  37.78 
 
 		 999 aa  56.6  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  35 
 
 		 6678 aa  56.6  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0013  F5/8 type C domain protein  32.08 
 
 		 663 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.538854 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3003  alpha-1,2-mannosidase  29.31 
 
 		 1053 aa  55.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.671088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0071  multicopper oxidase type 2  31.52 
 
 		 1299 aa  55.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  25.61 
 
 		 903 aa  55.1  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  35.44 
 
 		 779 aa  55.1  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  44.3 
 
 		 853 aa  54.7  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  37.35 
 
 		 2334 aa  54.7  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  24.28 
 
 		 670 aa  54.3  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  44.16 
 
 		 1272 aa  54.3  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  36.79 
 
 		 836 aa  53.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  37.62 
 
 		 1601 aa  52  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0459  hypothetical protein  32.47 
 
 		 478 aa  51.6  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0813872  normal  0.0506125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1213 aa  51.2  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1503  ATPase  25.69 
 
 		 674 aa  51.2  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000259399  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  32.97 
 
 		 673 aa  50.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3777  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1163 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0456  hypothetical protein  41.54 
 
 		 1062 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.97303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2553  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.85 
 
 		 728 aa  49.7  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  31.82 
 
 		 801 aa  49.7  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  28.12 
 
 		 448 aa  48.5  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  31.68 
 
 		 598 aa  48.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5053  hypothetical protein  31.68 
 
 		 533 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.83 
 
 		 1448 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  27.68 
 
 		 1124 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  32.95 
 
 		 639 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  41.77 
 
 		 1735 aa  47.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1086  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.2 
 
 		 665 aa  46.6  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.522215  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  28.57 
 
 		 617 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  27.01 
 
 		 887 aa  47  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.08 
 
 		 795 aa  47  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  36 
 
 		 1303 aa  46.6  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.69 
 
 		 1109 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05870  hypothetical protein  31.91 
 
 		 243 aa  45.8  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  36.11 
 
 		 1113 aa  45.8  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2150  hypothetical protein  32.1 
 
 		 356 aa  45.8  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  30.91 
 
 		 1247 aa  46.2  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22340  alpha-1,2-mannosidase, putative  24.24 
 
 		 1073 aa  45.4  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  24.76 
 
 		 803 aa  45.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2757  fibronectin, type III  37.66 
 
 		 490 aa  45.4  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.48041  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  39.51 
 
 		 14944 aa  45.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  26.73 
 
 		 996 aa  44.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  42.42 
 
 		 1200 aa  44.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  32.05 
 
 		 1668 aa  44.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2321  Fibronectin type III domain protein  38.38 
 
 		 701 aa  44.3  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  25.67 
 
 		 850 aa  44.3  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>