33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0296 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0123  coagulation factor 5/8 type-like  58.74 
 
 		 944 aa  1108    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0296  coagulation factor 5/8 type protein  100 
 
 		 954 aa  1947    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.464689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  41.46 
 
 		 1422 aa  102  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  41.46 
 
 		 1427 aa  102  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  40 
 
 		 1322 aa  97.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  36.57 
 
 		 834 aa  92.8  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  34.75 
 
 		 1426 aa  84.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  43.75 
 
 		 861 aa  82.8  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1786  hypothetical protein  38.52 
 
 		 475 aa  79  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3437  PKD domain containing protein  33.06 
 
 		 487 aa  77  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.639471  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0570  putative lipoprotein  31.91 
 
 		 338 aa  74.3  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5834  PKD domain-containing protein  35.77 
 
 		 206 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.552498  normal  0.42039 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4279  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4  36.84 
 
 		 718 aa  71.6  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1084  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.61 
 
 		 675 aa  64.7  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00047148  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2646  PKD domain-containing protein  34.65 
 
 		 540 aa  62.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671954  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2654  PKD domain-containing protein  32.73 
 
 		 690 aa  61.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  34.51 
 
 		 6678 aa  58.5  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  22.68 
 
 		 752 aa  58.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2555  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.28 
 
 		 736 aa  58.5  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.55 
 
 		 1448 aa  58.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0013  F5/8 type C domain protein  34.65 
 
 		 663 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.538854 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.92 
 
 		 1564 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2651  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4  34.02 
 
 		 506 aa  54.3  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.144451  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1085  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.2 
 
 		 669 aa  52.4  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  26.07 
 
 		 850 aa  52  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  26.99 
 
 		 1581 aa  51.6  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0121  hypothetical protein  28.46 
 
 		 362 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1086  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.81 
 
 		 665 aa  49.3  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.522215  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  24.9 
 
 		 1028 aa  45.8  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 		 578 aa  45.8  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2553  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.71 
 
 		 728 aa  45.1  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.43 
 
 		 674 aa  45.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.72 
 
 		 756 aa  44.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>