116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2654 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2654  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 690 aa  1416    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2646  PKD domain-containing protein  34.06 
 
 		 540 aa  319  1e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671954  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  42.15 
 
 		 1426 aa  99  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1651  Basic Secretory Protein  26.94 
 
 		 277 aa  95.1  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.17013 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5834  PKD domain-containing protein  33.67 
 
 		 206 aa  91.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.552498  normal  0.42039 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  37.84 
 
 		 1322 aa  91.3  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  36.89 
 
 		 1427 aa  87.8  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  37.7 
 
 		 1422 aa  87.8  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1786  hypothetical protein  42.52 
 
 		 475 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  32.54 
 
 		 861 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4279  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4  31.45 
 
 		 718 aa  77  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  33.1 
 
 		 1732 aa  77  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  45.12 
 
 		 821 aa  75.9  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0123  coagulation factor 5/8 type-like  39.58 
 
 		 944 aa  67.8  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  43.75 
 
 		 788 aa  67.4  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3437  PKD domain containing protein  43.18 
 
 		 487 aa  66.6  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.639471  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  39.56 
 
 		 528 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  35.92 
 
 		 1282 aa  65.1  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  26.67 
 
 		 834 aa  64.3  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  38.3 
 
 		 530 aa  63.9  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  35.05 
 
 		 3295 aa  63.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  35.05 
 
 		 2554 aa  61.6  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  35.29 
 
 		 1236 aa  61.6  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  32.2 
 
 		 1862 aa  61.6  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0296  coagulation factor 5/8 type protein  29.73 
 
 		 954 aa  61.2  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.464689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  34.62 
 
 		 978 aa  61.2  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2651  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4  31.68 
 
 		 506 aa  60.8  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.144451  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  27.23 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  29.84 
 
 		 971 aa  60.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  31.68 
 
 		 1667 aa  60.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  31.68 
 
 		 1361 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  35.87 
 
 		 1356 aa  59.3  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  30.93 
 
 		 859 aa  58.5  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  32.93 
 
 		 2272 aa  58.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  37.5 
 
 		 848 aa  58.2  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  32.93 
 
 		 2000 aa  57.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  40.79 
 
 		 735 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  35.37 
 
 		 1120 aa  57.4  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  28.46 
 
 		 561 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  34.44 
 
 		 1682 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  36.36 
 
 		 802 aa  56.6  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  27.81 
 
 		 1387 aa  55.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  32.93 
 
 		 1300 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  32.22 
 
 		 2036 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  30.68 
 
 		 1842 aa  55.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  36.36 
 
 		 941 aa  55.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  39.02 
 
 		 561 aa  55.5  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3003  alpha-1,2-mannosidase  34.38 
 
 		 1053 aa  55.1  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.671088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  40.26 
 
 		 958 aa  54.7  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  32.26 
 
 		 1882 aa  54.3  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  28.28 
 
 		 547 aa  54.3  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  29.29 
 
 		 581 aa  53.9  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  37.04 
 
 		 752 aa  53.9  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  33.64 
 
 		 845 aa  53.9  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  22.39 
 
 		 713 aa  53.5  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  28.28 
 
 		 679 aa  53.9  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  33.33 
 
 		 669 aa  53.9  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  29.13 
 
 		 2122 aa  53.5  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  32.67 
 
 		 1095 aa  53.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  45.31 
 
 		 838 aa  53.9  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  28.28 
 
 		 1094 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  32.35 
 
 		 675 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  43.84 
 
 		 861 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  34.83 
 
 		 910 aa  52.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  32.08 
 
 		 787 aa  52.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 823 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  29.29 
 
 		 658 aa  52.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  35 
 
 		 960 aa  52.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  28.28 
 
 		 575 aa  52.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  38.36 
 
 		 1292 aa  52.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  30.08 
 
 		 963 aa  52.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  30.93 
 
 		 184 aa  52  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  40.32 
 
 		 786 aa  51.6  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 870 aa  51.6  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  30.85 
 
 		 551 aa  51.6  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  33.33 
 
 		 519 aa  51.6  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1714  glycoside hydrolase family protein  36.11 
 
 		 951 aa  51.6  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  29.29 
 
 		 685 aa  51.2  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  37.65 
 
 		 930 aa  51.2  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  40.62 
 
 		 777 aa  51.2  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  34.58 
 
 		 819 aa  51.2  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  34.38 
 
 		 439 aa  50.8  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  29.21 
 
 		 500 aa  50.8  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  41.54 
 
 		 1814 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  30.86 
 
 		 615 aa  50.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  27.27 
 
 		 1241 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  28.05 
 
 		 1969 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  39.06 
 
 		 819 aa  49.3  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  29.07 
 
 		 1328 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  31.46 
 
 		 791 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  30.4 
 
 		 1189 aa  48.9  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  25.11 
 
 		 1042 aa  48.9  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  32.26 
 
 		 840 aa  48.9  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  32.1 
 
 		 1931 aa  48.9  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  26.67 
 
 		 644 aa  48.5  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  40.24 
 
 		 408 aa  48.5  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  35.71 
 
 		 719 aa  48.9  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  35.37 
 
 		 1092 aa  48.1  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  24.35 
 
 		 560 aa  47.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  32.22 
 
 		 725 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>