More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4788 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  45.14 
 
 		 1581 aa  845    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 		 1564 aa  3158    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.64 
 
 		 1158 aa  255  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  36.64 
 
 		 752 aa  243  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.35 
 
 		 762 aa  209  4e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.31 
 
 		 674 aa  202  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  44.69 
 
 		 1028 aa  197  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  30.53 
 
 		 737 aa  195  6e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1250  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.71 
 
 		 644 aa  192  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  44.44 
 
 		 987 aa  190  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  44.4 
 
 		 850 aa  189  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.16 
 
 		 962 aa  187  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  43.86 
 
 		 581 aa  186  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.93 
 
 		 915 aa  185  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  29.18 
 
 		 727 aa  181  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.15 
 
 		 815 aa  181  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  29.18 
 
 		 727 aa  180  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.89 
 
 		 733 aa  180  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04360  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  28.59 
 
 		 618 aa  176  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.117639 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2600  glycoside hydrolase family 3 protein  29.15 
 
 		 1271 aa  175  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0793818  decreased coverage  0.00832929 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  37.32 
 
 		 578 aa  174  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  26.69 
 
 		 743 aa  174  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  28.82 
 
 		 764 aa  169  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3307  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.68 
 
 		 659 aa  169  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  28.52 
 
 		 618 aa  168  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.36 
 
 		 751 aa  167  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.41 
 
 		 742 aa  167  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01804  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  26.43 
 
 		 618 aa  166  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.497793 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2344  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.39 
 
 		 608 aa  166  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.02 
 
 		 804 aa  165  6e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.92 
 
 		 702 aa  165  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2444  glycoside hydrolase family 3 protein  29.26 
 
 		 1271 aa  164  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592108  normal  0.597577 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  26.92 
 
 		 740 aa  164  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27 
 
 		 752 aa  164  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  27.16 
 
 		 805 aa  163  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.37 
 
 		 615 aa  162  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  28.37 
 
 		 758 aa  162  7e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  38.3 
 
 		 588 aa  158  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  27.84 
 
 		 750 aa  158  7e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  39.18 
 
 		 1441 aa  158  9e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.48 
 
 		 733 aa  157  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.59 
 
 		 609 aa  157  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.25 
 
 		 751 aa  156  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  27.6 
 
 		 859 aa  156  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2446  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.99 
 
 		 659 aa  155  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.802964  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.47 
 
 		 723 aa  155  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6710  Beta-glucosidase  28.19 
 
 		 671 aa  155  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.593883 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  27.97 
 
 		 772 aa  153  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.75 
 
 		 783 aa  152  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2514  glycoside hydrolase family 3 protein  29.06 
 
 		 743 aa  153  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0628734 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  27.59 
 
 		 745 aa  153  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4300  Beta-glucosidase  26.59 
 
 		 669 aa  153  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0170448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  26.9 
 
 		 765 aa  153  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  27.14 
 
 		 777 aa  152  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3725  glycosy hydrolase family protein  28.54 
 
 		 605 aa  151  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.59 
 
 		 754 aa  151  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  28.19 
 
 		 721 aa  150  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  27.35 
 
 		 763 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3136  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.03 
 
 		 759 aa  150  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.48 
 
 		 766 aa  149  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  26.26 
 
 		 743 aa  150  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5561  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  29.89 
 
 		 612 aa  149  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.56 
 
 		 769 aa  149  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1303  glycoside hydrolase family 3 protein  29.98 
 
 		 826 aa  148  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75334  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  26.28 
 
 		 790 aa  148  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2737  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.7 
 
 		 743 aa  148  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.728913 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  25.32 
 
 		 778 aa  148  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  29.22 
 
 		 759 aa  147  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  29.22 
 
 		 723 aa  147  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  29.14 
 
 		 738 aa  147  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  28.84 
 
 		 750 aa  147  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1318  Beta-glucosidase  27.41 
 
 		 880 aa  147  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  27.44 
 
 		 759 aa  146  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  25.48 
 
 		 778 aa  146  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.19 
 
 		 795 aa  146  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1800  beta-glucosidase  28.25 
 
 		 739 aa  146  3e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1732  glycoside hydrolase family 3 protein  28.94 
 
 		 740 aa  145  5e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  26.62 
 
 		 751 aa  145  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  27.88 
 
 		 766 aa  145  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3263  Beta-glucosidase  28.55 
 
 		 678 aa  144  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3149  Beta-glucosidase  26.06 
 
 		 663 aa  144  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167157  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  37.19 
 
 		 4013 aa  144  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3740  putative endoglucanase A  24.96 
 
 		 599 aa  144  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.821502  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  26.41 
 
 		 755 aa  144  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3972  glycoside hydrolase family 3 protein  29.98 
 
 		 763 aa  144  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471941  normal  0.534128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  26.41 
 
 		 755 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  26.82 
 
 		 765 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  25.64 
 
 		 772 aa  143  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.6 
 
 		 757 aa  144  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  26.41 
 
 		 755 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  28.07 
 
 		 765 aa  144  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.99 
 
 		 769 aa  144  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.82 
 
 		 765 aa  143  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3526  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.44 
 
 		 727 aa  143  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.045935 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  26.82 
 
 		 765 aa  143  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1689  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.4 
 
 		 619 aa  142  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  27.34 
 
 		 763 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  26.81 
 
 		 763 aa  142  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0152  glycoside hydrolase family 3 protein  28.62 
 
 		 826 aa  142  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0748056 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  26.17 
 
 		 765 aa  142  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>