131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2003 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  63.93 
 
 
722 aa  845    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  100 
 
 
850 aa  1701    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  60.33 
 
 
962 aa  697    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  50.27 
 
 
755 aa  660    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1518  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  52.83 
 
 
734 aa  578  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000763318  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  52.44 
 
 
732 aa  571  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0398  secreted protein  53.5 
 
 
640 aa  566  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2395  Fibronectin type III domain protein  52.42 
 
 
844 aa  553  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527977  decreased coverage  0.000101055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1676  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  50.89 
 
 
648 aa  553  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  51.28 
 
 
918 aa  554  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1385  secreted protein  51.83 
 
 
627 aa  535  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.195328  decreased coverage  0.000365007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6657  secreted protein  49.83 
 
 
645 aa  521  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3740  secreted protein  50.6 
 
 
640 aa  518  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253884  hitchhiker  0.00713649 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1718  secreted protein  51.7 
 
 
562 aa  495  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal  0.917754 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0054  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  47.6 
 
 
537 aa  490  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1669  secreted protein  46.26 
 
 
622 aa  483  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180028  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.84 
 
 
940 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2668  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  45.53 
 
 
652 aa  480  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  45.64 
 
 
2117 aa  478  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0200  hypothetical protein  37.18 
 
 
726 aa  337  3.9999999999999995e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5709  hypothetical protein  39.3 
 
 
722 aa  324  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  59.2 
 
 
987 aa  315  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  55.48 
 
 
674 aa  304  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  60.14 
 
 
1158 aa  283  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  48.8 
 
 
752 aa  265  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  62.55 
 
 
815 aa  265  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  52.94 
 
 
581 aa  260  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  43.81 
 
 
578 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  48.81 
 
 
588 aa  242  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  44.93 
 
 
4013 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  45.1 
 
 
1441 aa  206  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  40.88 
 
 
1581 aa  194  7e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  44 
 
 
915 aa  191  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.02 
 
 
1564 aa  181  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.43 
 
 
1362 aa  167  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  55.56 
 
 
433 aa  163  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  39.66 
 
 
578 aa  163  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  55.94 
 
 
1007 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  63.08 
 
 
449 aa  154  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  52.32 
 
 
571 aa  152  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  38.18 
 
 
1028 aa  149  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  65.15 
 
 
999 aa  145  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  53.6 
 
 
637 aa  138  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  60.98 
 
 
639 aa  137  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.66 
 
 
756 aa  130  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  49.28 
 
 
953 aa  129  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  43.87 
 
 
1070 aa  128  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  55.38 
 
 
452 aa  127  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.45 
 
 
1321 aa  124  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  49.62 
 
 
929 aa  123  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  50 
 
 
392 aa  123  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.16 
 
 
819 aa  121  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  40.74 
 
 
732 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  46.15 
 
 
1059 aa  118  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  35.23 
 
 
1184 aa  116  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  39.58 
 
 
801 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  48.18 
 
 
1338 aa  115  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  40.65 
 
 
558 aa  114  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.15 
 
 
971 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  40.65 
 
 
1103 aa  110  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  49.21 
 
 
879 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  46.62 
 
 
1332 aa  109  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  43.44 
 
 
1059 aa  104  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  26.73 
 
 
1471 aa  103  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.52 
 
 
729 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  46.03 
 
 
1117 aa  100  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  46.85 
 
 
471 aa  97.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.55 
 
 
1060 aa  95.1  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.93 
 
 
1139 aa  95.5  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.48 
 
 
984 aa  92.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.53 
 
 
472 aa  92  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.53 
 
 
472 aa  92  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  44.44 
 
 
695 aa  89.7  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.32 
 
 
478 aa  89.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  46.43 
 
 
470 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  43.55 
 
 
487 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  43.55 
 
 
487 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  45.86 
 
 
480 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  45.71 
 
 
470 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  45.71 
 
 
470 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4863  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  55.56 
 
 
112 aa  83.2  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483102  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  46.36 
 
 
475 aa  82.8  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  37.4 
 
 
722 aa  79.7  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  40 
 
 
820 aa  79  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.76 
 
 
1448 aa  77.8  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  27.92 
 
 
768 aa  73.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3845  hypothetical protein  27.04 
 
 
557 aa  72.4  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  27.43 
 
 
873 aa  70.5  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.1 
 
 
929 aa  69.3  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  39.73 
 
 
1439 aa  67  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1702  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.22 
 
 
1038 aa  66.6  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0553  discoidin domain-containing protein  34.15 
 
 
1061 aa  63.5  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326441  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.6 
 
 
795 aa  61.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.3 
 
 
986 aa  60.5  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  34.88 
 
 
644 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7141  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.3 
 
 
538 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  33.11 
 
 
899 aa  59.3  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1157  hypothetical protein  47.44 
 
 
151 aa  58.5  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  30.57 
 
 
2095 aa  57  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1016  glycoside hydrolase family protein  29.84 
 
 
880 aa  57.4  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>