69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4863 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4863  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  100 
 
 
112 aa  222  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483102  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  58.9 
 
 
1117 aa  89.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1157  hypothetical protein  77.78 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  55.56 
 
 
850 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  50.67 
 
 
722 aa  80.9  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  55.56 
 
 
953 aa  78.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  47.83 
 
 
392 aa  78.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  47.22 
 
 
801 aa  73.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.59 
 
 
756 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  44.44 
 
 
1581 aa  71.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  43.59 
 
 
1441 aa  71.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  44.44 
 
 
452 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  45.07 
 
 
987 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  45.83 
 
 
1070 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  52.78 
 
 
1564 aa  68.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  38.96 
 
 
752 aa  67.4  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  49.32 
 
 
581 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  44 
 
 
637 aa  67  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.21 
 
 
929 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  34.29 
 
 
571 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  47.22 
 
 
999 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.11 
 
 
962 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.86 
 
 
674 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  46.48 
 
 
578 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  45.83 
 
 
433 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  41.67 
 
 
588 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.96 
 
 
755 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.08 
 
 
1007 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  44.12 
 
 
1103 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  50 
 
 
1059 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  52 
 
 
819 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.89 
 
 
971 aa  60.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.44 
 
 
915 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.3 
 
 
1158 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  47.95 
 
 
1028 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  40.58 
 
 
732 aa  58.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.67 
 
 
815 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.33 
 
 
1139 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  49.3 
 
 
940 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  44.59 
 
 
449 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.22 
 
 
639 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.57 
 
 
984 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  42.86 
 
 
4013 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.65 
 
 
1321 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.33 
 
 
729 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  38.89 
 
 
695 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  37.97 
 
 
1184 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  37.72 
 
 
578 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  33.8 
 
 
1059 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  38.03 
 
 
558 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.97 
 
 
478 aa  51.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.5 
 
 
1362 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  40.28 
 
 
722 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.14 
 
 
472 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.14 
 
 
472 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  38.36 
 
 
470 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  36.99 
 
 
470 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  32.89 
 
 
487 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  35.53 
 
 
470 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  32.89 
 
 
487 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  32.89 
 
 
480 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  39.44 
 
 
879 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  35.53 
 
 
475 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  36.36 
 
 
1471 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.58 
 
 
471 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  37.84 
 
 
1332 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.35 
 
 
1060 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  31.58 
 
 
2117 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  38.57 
 
 
1338 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>