163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6648 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 
940 aa  1860    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  67.6 
 
 
755 aa  803    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6657  secreted protein  66.38 
 
 
645 aa  768    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1385  secreted protein  52.92 
 
 
627 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.195328  decreased coverage  0.000365007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.24 
 
 
962 aa  562  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2395  Fibronectin type III domain protein  49.66 
 
 
844 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527977  decreased coverage  0.000101055 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0398  secreted protein  48.26 
 
 
640 aa  531  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1718  secreted protein  51.27 
 
 
562 aa  512  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal  0.917754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  48.87 
 
 
918 aa  507  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  47.06 
 
 
850 aa  505  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3740  secreted protein  46.08 
 
 
640 aa  496  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253884  hitchhiker  0.00713649 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1518  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  44.06 
 
 
734 aa  463  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000763318  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.38 
 
 
722 aa  451  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  43.74 
 
 
732 aa  451  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1669  secreted protein  41.84 
 
 
622 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180028  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  41.22 
 
 
2117 aa  422  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2668  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.1 
 
 
652 aa  398  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1676  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  38.56 
 
 
648 aa  398  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0054  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  38.14 
 
 
537 aa  369  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0200  hypothetical protein  32.88 
 
 
726 aa  281  4e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5709  hypothetical protein  33.64 
 
 
722 aa  275  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  62.29 
 
 
433 aa  195  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  82.11 
 
 
639 aa  180  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  63.69 
 
 
588 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  54.12 
 
 
571 aa  174  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  61.31 
 
 
987 aa  174  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  59.55 
 
 
449 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  62.26 
 
 
1158 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  68 
 
 
1007 aa  167  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  49.74 
 
 
581 aa  164  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  71.54 
 
 
815 aa  158  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  52.23 
 
 
752 aa  157  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  54.94 
 
 
578 aa  156  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  66.92 
 
 
999 aa  156  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  58.06 
 
 
756 aa  151  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  58.65 
 
 
452 aa  139  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  60.48 
 
 
578 aa  138  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  52.38 
 
 
953 aa  137  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  50 
 
 
929 aa  136  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  48.23 
 
 
1070 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  50.79 
 
 
392 aa  134  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  48.78 
 
 
637 aa  134  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  43.95 
 
 
1441 aa  132  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  55.32 
 
 
1059 aa  130  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  53.12 
 
 
1321 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  51.88 
 
 
801 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.67 
 
 
819 aa  129  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  52.9 
 
 
729 aa  124  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  49.65 
 
 
1103 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  59.81 
 
 
1338 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  45.6 
 
 
732 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  41.96 
 
 
1581 aa  116  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  52.17 
 
 
471 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  55.56 
 
 
1564 aa  114  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  35.71 
 
 
4013 aa  114  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.68 
 
 
915 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.03 
 
 
971 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  47.76 
 
 
1332 aa  114  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  47.2 
 
 
1117 aa  114  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  48.31 
 
 
879 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  54.14 
 
 
480 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  54.35 
 
 
470 aa  110  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  53.38 
 
 
487 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  53.38 
 
 
487 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  38.66 
 
 
1059 aa  109  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.67 
 
 
984 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  43.08 
 
 
558 aa  108  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  53.28 
 
 
472 aa  105  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  53.28 
 
 
472 aa  105  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.38 
 
 
1362 aa  106  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  45.95 
 
 
695 aa  100  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  46.32 
 
 
1028 aa  98.6  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.24 
 
 
1139 aa  98.6  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  50 
 
 
470 aa  97.8  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  52.67 
 
 
475 aa  97.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  49.28 
 
 
470 aa  95.9  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  65 
 
 
551 aa  95.9  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  56.32 
 
 
652 aa  94.4  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  32 
 
 
820 aa  87.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1053  hypothetical protein  55.56 
 
 
514 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.03 
 
 
929 aa  87.4  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  38.21 
 
 
722 aa  85.9  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.1 
 
 
478 aa  85.1  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1049  hypothetical protein  55.7 
 
 
599 aa  83.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17037  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  38.35 
 
 
1471 aa  82.4  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  49.4 
 
 
1060 aa  75.5  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1702  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.9 
 
 
1038 aa  75.1  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7141  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.36 
 
 
538 aa  73.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  43.22 
 
 
793 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0165  WD-40 repeat-containing protein  38.74 
 
 
848 aa  73.6  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.748884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.42 
 
 
1448 aa  72.8  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4863  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  49.3 
 
 
112 aa  69.7  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483102  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  39.84 
 
 
644 aa  68.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  46.91 
 
 
1756 aa  67  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0553  discoidin domain-containing protein  30.41 
 
 
1061 aa  65.9  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  35.26 
 
 
1200 aa  64.7  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  39.39 
 
 
1184 aa  63.9  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  35.77 
 
 
1951 aa  64.3  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  48.61 
 
 
758 aa  63.5  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.69 
 
 
1212 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232079 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>