97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1468 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  82.66 
 
 
715 aa  1023    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  100 
 
 
793 aa  1625    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  97.33 
 
 
630 aa  1014    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  53.19 
 
 
604 aa  572  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  49.8 
 
 
605 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  46.86 
 
 
565 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  39.34 
 
 
587 aa  351  3e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  32.58 
 
 
482 aa  195  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  32.29 
 
 
462 aa  194  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  32.08 
 
 
461 aa  193  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  32.07 
 
 
462 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  31.85 
 
 
462 aa  190  9e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  32.83 
 
 
462 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  31.52 
 
 
462 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  32.39 
 
 
462 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  30.65 
 
 
468 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  32.14 
 
 
542 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  32.96 
 
 
488 aa  184  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  29.58 
 
 
541 aa  183  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  31.33 
 
 
471 aa  182  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  30.93 
 
 
464 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  29.98 
 
 
464 aa  179  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  29.14 
 
 
474 aa  178  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  29.08 
 
 
469 aa  179  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  28.93 
 
 
524 aa  173  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  30.31 
 
 
567 aa  172  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  30.79 
 
 
485 aa  172  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  29.02 
 
 
506 aa  171  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  28.95 
 
 
474 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  31.86 
 
 
483 aa  168  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  44.41 
 
 
1657 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  28.73 
 
 
467 aa  163  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  28.25 
 
 
576 aa  163  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  28.82 
 
 
535 aa  162  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  30.22 
 
 
467 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  27.89 
 
 
564 aa  160  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  28.64 
 
 
535 aa  159  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  28.54 
 
 
535 aa  158  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  27.94 
 
 
535 aa  156  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  28.36 
 
 
550 aa  152  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  26.71 
 
 
535 aa  150  8e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  28.16 
 
 
557 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  27.27 
 
 
555 aa  146  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  25.81 
 
 
551 aa  145  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3167  S-layer domain-containing protein  42.05 
 
 
637 aa  137  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  25.49 
 
 
539 aa  134  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  26.78 
 
 
457 aa  132  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  24.57 
 
 
456 aa  127  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 
652 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  24.73 
 
 
459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  24.89 
 
 
459 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  27.84 
 
 
538 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  25.59 
 
 
463 aa  121  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  24.95 
 
 
459 aa  120  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  24.57 
 
 
461 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  24.95 
 
 
458 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  25.24 
 
 
780 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  25 
 
 
777 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  24.78 
 
 
454 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  25 
 
 
777 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  46.72 
 
 
1951 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  38.89 
 
 
2117 aa  92.8  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  37.02 
 
 
1825 aa  92.8  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  43.9 
 
 
551 aa  92  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1049  hypothetical protein  40.22 
 
 
599 aa  89  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17037  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1053  hypothetical protein  38.04 
 
 
514 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4198  alpha amylase catalytic region  32.96 
 
 
878 aa  84.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0148  alpha amylase catalytic region  31.87 
 
 
878 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0174055 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4158  alpha amylase catalytic region  32.4 
 
 
878 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  52.05 
 
 
940 aa  64.7  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21200  copper binding protein, plastocyanin/azurin family  26.46 
 
 
513 aa  60.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229231  normal  0.551456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.05 
 
 
639 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3358  hypothetical protein  33.15 
 
 
743 aa  57.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0199152 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  31.37 
 
 
549 aa  56.2  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2865  Fibronectin type III domain protein  36.96 
 
 
759 aa  56.2  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1427  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.45 
 
 
696 aa  54.3  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000366898  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0346  hypothetical protein  34.03 
 
 
635 aa  54.3  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0165  WD-40 repeat-containing protein  36.05 
 
 
848 aa  51.2  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.748884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  34.4 
 
 
758 aa  51.2  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.3 
 
 
788 aa  50.8  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  40.79 
 
 
1937 aa  49.7  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1107  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  34.18 
 
 
788 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  24 
 
 
1756 aa  49.7  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  31.94 
 
 
1026 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  29.53 
 
 
777 aa  49.3  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  34.18 
 
 
788 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.18 
 
 
788 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.37 
 
 
788 aa  47.8  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  34.18 
 
 
788 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1171  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.18 
 
 
788 aa  47.8  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  36.99 
 
 
788 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1484  hypothetical protein  35.43 
 
 
1128 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.91 
 
 
788 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487379  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  31.34 
 
 
14944 aa  45.8  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  37.97 
 
 
1467 aa  45.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04330  putative carbohydrate-binding protein with Ig-like domain and F5/8 type C domain  32.98 
 
 
1197 aa  44.7  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.647548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  35.53 
 
 
569 aa  44.3  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>