More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0141 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  100 
 
 
758 aa  1475    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  42.61 
 
 
1081 aa  198  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  53.22 
 
 
518 aa  193  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  51.93 
 
 
820 aa  191  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  52.98 
 
 
526 aa  189  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  51.18 
 
 
625 aa  187  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  52.44 
 
 
1194 aa  183  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  53.05 
 
 
457 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  52.98 
 
 
548 aa  178  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  34.75 
 
 
1321 aa  177  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  42.31 
 
 
218 aa  160  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  45.16 
 
 
1821 aa  159  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  43.89 
 
 
506 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  31.55 
 
 
1421 aa  145  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  41.24 
 
 
693 aa  139  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  39.78 
 
 
1009 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  30.72 
 
 
1710 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  42.68 
 
 
932 aa  131  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  38.8 
 
 
573 aa  130  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  41.53 
 
 
935 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  37.25 
 
 
1226 aa  128  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.59 
 
 
1016 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  39.78 
 
 
629 aa  125  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  36.93 
 
 
920 aa  125  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  41.18 
 
 
1208 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1924  hypothetical protein  35.15 
 
 
657 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.398091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  34.09 
 
 
4630 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  38.95 
 
 
1013 aa  121  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  37.02 
 
 
685 aa  120  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  41.04 
 
 
710 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  39.66 
 
 
921 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  38.38 
 
 
288 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  34.98 
 
 
926 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  40 
 
 
1174 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  38.22 
 
 
880 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  35.39 
 
 
660 aa  117  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.43 
 
 
1328 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  37.14 
 
 
624 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  36.47 
 
 
531 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  38.01 
 
 
542 aa  115  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  33.94 
 
 
692 aa  114  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  38.67 
 
 
767 aa  114  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  35.23 
 
 
414 aa  114  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.11 
 
 
1661 aa  114  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  35.47 
 
 
223 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  35.16 
 
 
548 aa  112  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  33.77 
 
 
575 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2877  S-layer-like domain-containing protein  35.14 
 
 
585 aa  110  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  35.87 
 
 
733 aa  109  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  35.06 
 
 
506 aa  109  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  36.65 
 
 
807 aa  108  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  35.76 
 
 
1168 aa  107  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2613  S-layer-like domain-containing protein  37.14 
 
 
286 aa  107  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  37.21 
 
 
1847 aa  107  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  35.23 
 
 
413 aa  106  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  30.98 
 
 
3027 aa  106  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  31.82 
 
 
413 aa  105  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  32.4 
 
 
1260 aa  104  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  34.64 
 
 
431 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2783  S-layer domain protein  31.34 
 
 
1154 aa  103  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.364691  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  34.95 
 
 
939 aa  103  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  33.72 
 
 
1042 aa  103  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  35.36 
 
 
914 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  35.05 
 
 
554 aa  103  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  28.74 
 
 
2207 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  35.68 
 
 
524 aa  102  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.97 
 
 
1029 aa  102  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  36.13 
 
 
822 aa  102  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000577462  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  31.63 
 
 
461 aa  102  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  31.63 
 
 
461 aa  101  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  31.63 
 
 
461 aa  101  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  31.63 
 
 
461 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  44.14 
 
 
631 aa  101  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  34.76 
 
 
1223 aa  100  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  31.16 
 
 
461 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  36.84 
 
 
618 aa  99.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  34.25 
 
 
756 aa  99.8  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.6 
 
 
1234 aa  95.9  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0975  S-layer protein EA1  32.77 
 
 
863 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000553738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  33.68 
 
 
552 aa  95.1  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  33.53 
 
 
693 aa  95.5  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3210  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.21 
 
 
533 aa  95.1  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1149  S-layer domain protein  28.95 
 
 
376 aa  95.1  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  38.51 
 
 
688 aa  94.7  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase and S-layer protein fusion  36.05 
 
 
599 aa  94.4  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0788  S-layer protein, peptidoglycan endo-beta-N-acetylglucosaminidase and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion  34.15 
 
 
615 aa  94.4  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  0.00000000000000356588  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5468  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.63 
 
 
533 aa  94  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000294756  normal  0.0109567 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1979  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.05 
 
 
599 aa  94  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1075  S-layer-like domain-containing protein  31.09 
 
 
376 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3120  S-layer domain protein  34.7 
 
 
627 aa  93.2  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0933  S-layer protein  30.74 
 
 
620 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000133918  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2160  S-layer protein  31.94 
 
 
383 aa  92  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.028807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2340  putative S-layer protein  31.94 
 
 
383 aa  92  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2315  S-layer protein  31.94 
 
 
383 aa  92  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144535  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2116  S-layer domain-containing protein  33.52 
 
 
748 aa  91.3  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.344579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  29.64 
 
 
2117 aa  90.9  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.19 
 
 
995 aa  91.3  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  40 
 
 
2313 aa  90.9  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  32.74 
 
 
546 aa  90.1  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  32.4 
 
 
558 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>