42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1053 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1053  hypothetical protein  100 
 
 
514 aa  1017    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1049  hypothetical protein  88.71 
 
 
599 aa  817    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17037  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  45.24 
 
 
652 aa  127  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  40.98 
 
 
551 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2782  hypothetical protein  32.79 
 
 
277 aa  94  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2962  hypothetical protein  31.91 
 
 
277 aa  90.5  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2870  hypothetical protein  31.91 
 
 
277 aa  90.1  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  38.51 
 
 
793 aa  87.4  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  57.89 
 
 
639 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  55.41 
 
 
940 aa  81.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4498  hypothetical protein  27.59 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1484  hypothetical protein  32.09 
 
 
1128 aa  73.6  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0165  WD-40 repeat-containing protein  40.66 
 
 
848 aa  70.9  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.748884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  40.43 
 
 
1756 aa  65.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4198  alpha amylase catalytic region  32.57 
 
 
878 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4158  alpha amylase catalytic region  32 
 
 
878 aa  63.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  31.1 
 
 
1825 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  29.14 
 
 
1657 aa  60.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  41.86 
 
 
758 aa  59.3  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3167  S-layer domain-containing protein  27.71 
 
 
637 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  40 
 
 
621 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  26.8 
 
 
2117 aa  51.6  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04330  putative carbohydrate-binding protein with Ig-like domain and F5/8 type C domain  39.58 
 
 
1197 aa  51.6  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.647548 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  33.33 
 
 
1951 aa  51.2  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.44 
 
 
788 aa  51.2  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  38.03 
 
 
1937 aa  51.2  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.91 
 
 
788 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  32.91 
 
 
788 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1107  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  32.91 
 
 
788 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.91 
 
 
788 aa  50.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  32.91 
 
 
788 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  32.88 
 
 
788 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  38.1 
 
 
1467 aa  48.9  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0148  alpha amylase catalytic region  28.81 
 
 
878 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0174055 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1171  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.91 
 
 
788 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.65 
 
 
788 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487379  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  30.43 
 
 
1226 aa  47.4  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  29.72 
 
 
14944 aa  47.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.91 
 
 
790 aa  47  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  36.07 
 
 
702 aa  44.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1155  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  27.96 
 
 
1949 aa  43.5  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2856  hypothetical protein  40.28 
 
 
1117 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00658326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>