109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3972 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 		 929 aa  1902    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3979  polysaccharide lyase family 8  35.7 
 
 		 718 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0786  polysaccharide lyase family 8  27.78 
 
 		 700 aa  221  6e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4325  chondroitin AC lyase  27.05 
 
 		 693 aa  182  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3863  Chondroitin AC lyase  23.05 
 
 		 656 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.569924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0500  polysaccharide lyase family 8  25.26 
 
 		 533 aa  137  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346359  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3227  Hyaluronate lyase  24.81 
 
 		 1131 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4980  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  24.74 
 
 		 797 aa  113  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00611188  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2840  polysaccharide lyase family 8  24.19 
 
 		 989 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.109346  normal  0.0108324 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0394  polysaccharide lyase family protein 8  22.16 
 
 		 1003 aa  108  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0390  polysaccharide lyase family protein 8  21.57 
 
 		 985 aa  100  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.918566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7449  hypothetical protein  25.26 
 
 		 636 aa  99.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0850  Hyaluronate lyase  24.1 
 
 		 792 aa  93.6  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6725  Hyaluronate lyase  24.17 
 
 		 576 aa  94  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0932  polysaccharide lyase family protein 8  22.55 
 
 		 750 aa  89.7  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0363871  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1698  hyaluronate lyase  23.24 
 
 		 793 aa  84.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222511  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2232  polysaccharide lyase family protein 8  20.86 
 
 		 809 aa  82  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2271  polysaccharide lyase family protein 8  20.86 
 
 		 809 aa  82  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0352  hyaluronate lyase  19.85 
 
 		 791 aa  79  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  39.74 
 
 		 752 aa  77  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  37.42 
 
 		 433 aa  77.4  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.86 
 
 		 1001 aa  75.1  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.97 
 
 		 962 aa  72.8  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.78 
 
 		 1109 aa  71.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.4 
 
 		 1448 aa  70.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  32.5 
 
 		 1200 aa  70.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  38.1 
 
 		 850 aa  69.3  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.09 
 
 		 1158 aa  68.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.11 
 
 		 674 aa  68.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  37.59 
 
 		 801 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  32.89 
 
 		 571 aa  68.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.52 
 
 		 639 aa  68.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.6 
 
 		 940 aa  68.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4208  Hyaluronate lyase  20.76 
 
 		 753 aa  67.4  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.431721  hitchhiker  0.000853972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.33 
 
 		 953 aa  67  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  36.09 
 
 		 1441 aa  66.6  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.76 
 
 		 722 aa  66.6  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0125  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  21.01 
 
 		 739 aa  66.2  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  34.31 
 
 		 1028 aa  65.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.84 
 
 		 815 aa  66.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.19 
 
 		 933 aa  66.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1197  hyaluronate lyase  22.41 
 
 		 1072 aa  65.9  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.32 
 
 		 795 aa  65.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  39.55 
 
 		 987 aa  65.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  37.31 
 
 		 879 aa  65.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  37.5 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.6 
 
 		 755 aa  64.7  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  38 
 
 		 1007 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  29.32 
 
 		 392 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.69 
 
 		 1212 aa  63.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  33.33 
 
 		 588 aa  63.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  33.11 
 
 		 1581 aa  62.4  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.37 
 
 		 729 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  37.31 
 
 		 1059 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.85 
 
 		 756 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.3 
 
 		 1362 aa  58.9  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0784  Lyase catalytic  19.68 
 
 		 1030 aa  58.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  33.33 
 
 		 1103 aa  58.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  36.3 
 
 		 581 aa  57.8  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  35.34 
 
 		 452 aa  57.4  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  37.78 
 
 		 999 aa  57  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  33.11 
 
 		 818 aa  57  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.15 
 
 		 1321 aa  56.2  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.33 
 
 		 915 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2256  chondroitinase  22.83 
 
 		 1043 aa  56.2  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824242 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  32.12 
 
 		 471 aa  55.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.75 
 
 		 819 aa  55.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  31.16 
 
 		 578 aa  55.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  31.85 
 
 		 637 aa  55.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  31.88 
 
 		 1070 aa  53.9  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4062  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  21.48 
 
 		 892 aa  53.9  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.505411  normal  0.685622 
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  35.4 
 
 		 475 aa  53.5  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  35.77 
 
 		 578 aa  53.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.62 
 
 		 472 aa  53.5  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.62 
 
 		 472 aa  53.5  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2838  Lyase catalytic  21.19 
 
 		 1077 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102032 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.4 
 
 		 1564 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1751  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.77 
 
 		 576 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  32.84 
 
 		 480 aa  52.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0174  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  21.22 
 
 		 846 aa  52.4  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.32 
 
 		 971 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  34.55 
 
 		 4013 aa  52  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  32.09 
 
 		 487 aa  51.6  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  32.09 
 
 		 487 aa  51.6  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.13 
 
 		 1139 aa  51.6  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3784  Glycoprotein endo-alpha-1,2-mannosidase  36.47 
 
 		 510 aa  51.6  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00391126  normal  0.836971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  27.34 
 
 		 644 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  31.45 
 
 		 873 aa  50.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.46 
 
 		 929 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.9 
 
 		 820 aa  50.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  26.45 
 
 		 1213 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  30.72 
 
 		 558 aa  49.3  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3298  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.53 
 
 		 593 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.679676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.39 
 
 		 470 aa  49.3  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  36 
 
 		 1441 aa  48.1  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0553  discoidin domain-containing protein  28.69 
 
 		 1061 aa  47.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326441  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  31.39 
 
 		 470 aa  47.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  35.16 
 
 		 1059 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  27.27 
 
 		 1164 aa  47.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.66 
 
 		 470 aa  47  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>