23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0784 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0784  Lyase catalytic  100 
 
 		 1030 aa  2151    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2256  chondroitinase  35.48 
 
 		 1043 aa  604  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824242 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0997  lyase catalytic  27.81 
 
 		 1024 aa  350  7e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0946  polysaccharide lyase family protein 8  27.81 
 
 		 1024 aa  350  9e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3277  polysaccharide lyase family protein 8  27.7 
 
 		 1024 aa  349  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2838  Lyase catalytic  25 
 
 		 1077 aa  252  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102032 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0786  polysaccharide lyase family 8  25.25 
 
 		 700 aa  79.7  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0390  polysaccharide lyase family protein 8  23.81 
 
 		 985 aa  76.6  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.918566  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0394  polysaccharide lyase family protein 8  23.41 
 
 		 1003 aa  74.7  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1698  hyaluronate lyase  27.68 
 
 		 793 aa  63.9  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222511  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3227  Hyaluronate lyase  21.94 
 
 		 1131 aa  60.5  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0500  polysaccharide lyase family 8  27.83 
 
 		 533 aa  59.3  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7449  hypothetical protein  28.92 
 
 		 636 aa  58.9  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4325  chondroitin AC lyase  23.22 
 
 		 693 aa  58.2  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  19.68 
 
 		 929 aa  58.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3979  polysaccharide lyase family 8  23 
 
 		 718 aa  55.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0932  polysaccharide lyase family protein 8  20.66 
 
 		 750 aa  54.7  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0363871  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0352  hyaluronate lyase  23.7 
 
 		 791 aa  51.6  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6725  Hyaluronate lyase  25.46 
 
 		 576 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0850  Hyaluronate lyase  22.8 
 
 		 792 aa  49.3  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4980  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  24.63 
 
 		 797 aa  48.9  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00611188  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2840  polysaccharide lyase family 8  21.54 
 
 		 989 aa  46.2  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.109346  normal  0.0108324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4208  Hyaluronate lyase  23.34 
 
 		 753 aa  46.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.431721  hitchhiker  0.000853972 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>