28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1698 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1698  hyaluronate lyase  100 
 
 		 793 aa  1619    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222511  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3227  Hyaluronate lyase  35.38 
 
 		 1131 aa  432  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4208  Hyaluronate lyase  38.94 
 
 		 753 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.431721  hitchhiker  0.000853972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6725  Hyaluronate lyase  39.78 
 
 		 576 aa  361  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0850  Hyaluronate lyase  36.01 
 
 		 792 aa  355  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0390  polysaccharide lyase family protein 8  29.05 
 
 		 985 aa  335  3e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.918566  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0394  polysaccharide lyase family protein 8  29.55 
 
 		 1003 aa  332  2e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4980  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  33.12 
 
 		 797 aa  330  8e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00611188  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0352  hyaluronate lyase  26.4 
 
 		 791 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4062  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  31.28 
 
 		 892 aa  271  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.505411  normal  0.685622 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2232  polysaccharide lyase family protein 8  26.59 
 
 		 809 aa  267  7e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2271  polysaccharide lyase family protein 8  26.59 
 
 		 809 aa  267  7e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1197  hyaluronate lyase  25.87 
 
 		 1072 aa  249  1e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0125  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  26.15 
 
 		 739 aa  228  4e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0174  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  29.58 
 
 		 846 aa  205  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0117  Hyaluronate lyase  24.86 
 
 		 618 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0786  polysaccharide lyase family 8  24.89 
 
 		 700 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4325  chondroitin AC lyase  27.65 
 
 		 693 aa  134  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3979  polysaccharide lyase family 8  24.05 
 
 		 718 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0500  polysaccharide lyase family 8  28.36 
 
 		 533 aa  108  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7449  hypothetical protein  32.78 
 
 		 636 aa  100  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.24 
 
 		 929 aa  89.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3863  Chondroitin AC lyase  22.51 
 
 		 656 aa  81.3  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.569924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0932  polysaccharide lyase family protein 8  22.51 
 
 		 750 aa  66.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0363871  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0784  Lyase catalytic  27.68 
 
 		 1030 aa  63.9  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2840  polysaccharide lyase family 8  25.91 
 
 		 989 aa  61.6  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.109346  normal  0.0108324 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2838  Lyase catalytic  21.39 
 
 		 1077 aa  55.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102032 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0946  polysaccharide lyase family protein 8  25.14 
 
 		 1024 aa  46.6  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>