31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0500 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0500  polysaccharide lyase family 8  100 
 
 		 533 aa  1058    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7449  hypothetical protein  55.7 
 
 		 636 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4325  chondroitin AC lyase  35.2 
 
 		 693 aa  238  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0786  polysaccharide lyase family 8  29.43 
 
 		 700 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3979  polysaccharide lyase family 8  27.89 
 
 		 718 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3863  Chondroitin AC lyase  28.89 
 
 		 656 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.569924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.01 
 
 		 929 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3227  Hyaluronate lyase  28.39 
 
 		 1131 aa  124  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4980  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  26.32 
 
 		 797 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00611188  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4208  Hyaluronate lyase  30.24 
 
 		 753 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.431721  hitchhiker  0.000853972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6725  Hyaluronate lyase  31.38 
 
 		 576 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0125  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  23.97 
 
 		 739 aa  109  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0850  Hyaluronate lyase  27.57 
 
 		 792 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0390  polysaccharide lyase family protein 8  21.53 
 
 		 985 aa  103  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.918566  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1698  hyaluronate lyase  28.2 
 
 		 793 aa  100  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222511  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0394  polysaccharide lyase family protein 8  21.21 
 
 		 1003 aa  99  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2232  polysaccharide lyase family protein 8  21.76 
 
 		 809 aa  89.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2271  polysaccharide lyase family protein 8  21.76 
 
 		 809 aa  89.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0352  hyaluronate lyase  21.66 
 
 		 791 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1197  hyaluronate lyase  21.05 
 
 		 1072 aa  83.2  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0174  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  26.53 
 
 		 846 aa  77  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0117  Hyaluronate lyase  19.63 
 
 		 618 aa  65.5  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0932  polysaccharide lyase family protein 8  24.88 
 
 		 750 aa  64.7  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0363871  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2840  polysaccharide lyase family 8  26.51 
 
 		 989 aa  60.8  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.109346  normal  0.0108324 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0784  Lyase catalytic  27.83 
 
 		 1030 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2256  chondroitinase  30.7 
 
 		 1043 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824242 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4062  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  27.11 
 
 		 892 aa  54.3  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.505411  normal  0.685622 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2838  Lyase catalytic  26.52 
 
 		 1077 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102032 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0946  polysaccharide lyase family protein 8  23.05 
 
 		 1024 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3277  polysaccharide lyase family protein 8  23.05 
 
 		 1024 aa  45.8  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028263 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0997  lyase catalytic  23.05 
 
 		 1024 aa  45.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>