22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2256 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2256  chondroitinase  100 
 
 		 1043 aa  2122    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0784  Lyase catalytic  35.48 
 
 		 1030 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0946  polysaccharide lyase family protein 8  31.47 
 
 		 1024 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3277  polysaccharide lyase family protein 8  31.38 
 
 		 1024 aa  436  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028263 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0997  lyase catalytic  31.47 
 
 		 1024 aa  436  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2838  Lyase catalytic  23.42 
 
 		 1077 aa  207  8e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102032 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0390  polysaccharide lyase family protein 8  24.86 
 
 		 985 aa  81.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.918566  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0394  polysaccharide lyase family protein 8  24.79 
 
 		 1003 aa  79.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0786  polysaccharide lyase family 8  25.67 
 
 		 700 aa  69.7  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4980  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  25.4 
 
 		 797 aa  63.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00611188  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3979  polysaccharide lyase family 8  24.22 
 
 		 718 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7449  hypothetical protein  29.3 
 
 		 636 aa  58.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0352  hyaluronate lyase  24.45 
 
 		 791 aa  56.2  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.83 
 
 		 929 aa  55.8  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0500  polysaccharide lyase family 8  30.7 
 
 		 533 aa  55.1  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4208  Hyaluronate lyase  25.61 
 
 		 753 aa  55.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.431721  hitchhiker  0.000853972 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2840  polysaccharide lyase family 8  26.5 
 
 		 989 aa  53.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.109346  normal  0.0108324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6725  Hyaluronate lyase  23.59 
 
 		 576 aa  53.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4325  chondroitin AC lyase  26.25 
 
 		 693 aa  52.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3227  Hyaluronate lyase  23.7 
 
 		 1131 aa  51.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4062  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  23.63 
 
 		 892 aa  48.9  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.505411  normal  0.685622 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0174  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  28.04 
 
 		 846 aa  47  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>