16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2840 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2840  polysaccharide lyase family 8  100 
 
 		 989 aa  2039    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.109346  normal  0.0108324 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.19 
 
 		 929 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0786  polysaccharide lyase family 8  23.68 
 
 		 700 aa  77.8  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3979  polysaccharide lyase family 8  26.16 
 
 		 718 aa  76.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7449  hypothetical protein  26.69 
 
 		 636 aa  74.3  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4325  chondroitin AC lyase  25.86 
 
 		 693 aa  71.2  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0932  polysaccharide lyase family protein 8  24.64 
 
 		 750 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0363871  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1698  hyaluronate lyase  25.91 
 
 		 793 aa  62.4  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222511  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1197  hyaluronate lyase  28.05 
 
 		 1072 aa  60.8  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0500  polysaccharide lyase family 8  26.51 
 
 		 533 aa  60.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346359  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0352  hyaluronate lyase  22.37 
 
 		 791 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4208  Hyaluronate lyase  25.96 
 
 		 753 aa  54.3  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.431721  hitchhiker  0.000853972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2256  chondroitinase  26.5 
 
 		 1043 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824242 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3227  Hyaluronate lyase  23.33 
 
 		 1131 aa  48.5  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4980  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  22.36 
 
 		 797 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00611188  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0784  Lyase catalytic  21.54 
 
 		 1030 aa  46.2  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>