20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2838 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2838  Lyase catalytic  100 
 
 		 1077 aa  2234    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102032 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0784  Lyase catalytic  25 
 
 		 1030 aa  252  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2256  chondroitinase  23.42 
 
 		 1043 aa  207  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824242 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0946  polysaccharide lyase family protein 8  24.92 
 
 		 1024 aa  206  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0997  lyase catalytic  24.82 
 
 		 1024 aa  205  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3277  polysaccharide lyase family protein 8  24.67 
 
 		 1024 aa  204  9e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0786  polysaccharide lyase family 8  24.78 
 
 		 700 aa  75.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3979  polysaccharide lyase family 8  23.17 
 
 		 718 aa  71.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0394  polysaccharide lyase family protein 8  23.01 
 
 		 1003 aa  68.2  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0390  polysaccharide lyase family protein 8  22.41 
 
 		 985 aa  67  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.918566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6725  Hyaluronate lyase  22.15 
 
 		 576 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3227  Hyaluronate lyase  22.27 
 
 		 1131 aa  60.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4208  Hyaluronate lyase  21.78 
 
 		 753 aa  57.4  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.431721  hitchhiker  0.000853972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4980  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  22.57 
 
 		 797 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00611188  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1698  hyaluronate lyase  21.39 
 
 		 793 aa  55.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222511  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  21.19 
 
 		 929 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0500  polysaccharide lyase family 8  26.46 
 
 		 533 aa  48.9  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7449  hypothetical protein  22.19 
 
 		 636 aa  48.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0850  Hyaluronate lyase  20 
 
 		 792 aa  47.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4325  chondroitin AC lyase  23.29 
 
 		 693 aa  45.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>