36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3227 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3227  Hyaluronate lyase  100 
 
 		 1131 aa  2281    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4208  Hyaluronate lyase  40.8 
 
 		 753 aa  496  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.431721  hitchhiker  0.000853972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0850  Hyaluronate lyase  37.16 
 
 		 792 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1698  hyaluronate lyase  35.38 
 
 		 793 aa  426  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4980  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  35.3 
 
 		 797 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00611188  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0394  polysaccharide lyase family protein 8  30.04 
 
 		 1003 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0390  polysaccharide lyase family protein 8  30.42 
 
 		 985 aa  409  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.918566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6725  Hyaluronate lyase  39.57 
 
 		 576 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0352  hyaluronate lyase  27.79 
 
 		 791 aa  335  4e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2271  polysaccharide lyase family protein 8  27.9 
 
 		 809 aa  296  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2232  polysaccharide lyase family protein 8  27.9 
 
 		 809 aa  296  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4062  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  29.64 
 
 		 892 aa  284  7.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.505411  normal  0.685622 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1197  hyaluronate lyase  27.23 
 
 		 1072 aa  280  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0125  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  27.34 
 
 		 739 aa  243  1e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0174  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  27.88 
 
 		 846 aa  231  7e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0786  polysaccharide lyase family 8  24.79 
 
 		 700 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0117  Hyaluronate lyase  26.49 
 
 		 618 aa  162  4e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4325  chondroitin AC lyase  27.96 
 
 		 693 aa  157  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3979  polysaccharide lyase family 8  23.32 
 
 		 718 aa  149  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.81 
 
 		 929 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0500  polysaccharide lyase family 8  28.39 
 
 		 533 aa  124  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7449  hypothetical protein  32.88 
 
 		 636 aa  119  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  31.9 
 
 		 748 aa  86.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1284  metallophosphoesterase  34.91 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.543211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.18 
 
 		 1246 aa  74.7  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3863  Chondroitin AC lyase  20.83 
 
 		 656 aa  73.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.569924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0932  polysaccharide lyase family protein 8  22.01 
 
 		 750 aa  71.2  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0363871  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  32.68 
 
 		 1657 aa  70.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0946  polysaccharide lyase family protein 8  24.64 
 
 		 1024 aa  62.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2838  Lyase catalytic  22.27 
 
 		 1077 aa  60.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102032 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0784  Lyase catalytic  22.47 
 
 		 1030 aa  60.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3277  polysaccharide lyase family protein 8  24.36 
 
 		 1024 aa  60.1  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028263 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0997  lyase catalytic  24.36 
 
 		 1024 aa  59.7  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2256  chondroitinase  23.7 
 
 		 1043 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2840  polysaccharide lyase family 8  23.33 
 
 		 989 aa  48.9  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.109346  normal  0.0108324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1825  Fibronectin type III domain protein  34.53 
 
 		 1009 aa  47.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0101556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>