23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3863 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3863  Chondroitin AC lyase  100 
 
 		 656 aa  1371    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.569924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4325  chondroitin AC lyase  28.82 
 
 		 693 aa  266  8.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3979  polysaccharide lyase family 8  27.42 
 
 		 718 aa  229  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0786  polysaccharide lyase family 8  27.07 
 
 		 700 aa  227  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7449  hypothetical protein  27.55 
 
 		 636 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0500  polysaccharide lyase family 8  28.89 
 
 		 533 aa  184  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346359  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.05 
 
 		 929 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0352  hyaluronate lyase  22.19 
 
 		 791 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1698  hyaluronate lyase  22.37 
 
 		 793 aa  77.4  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4980  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  25.51 
 
 		 797 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00611188  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3227  Hyaluronate lyase  20.83 
 
 		 1131 aa  74.3  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0125  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  20.58 
 
 		 739 aa  72  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1197  hyaluronate lyase  20.81 
 
 		 1072 aa  63.9  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0932  polysaccharide lyase family protein 8  23.4 
 
 		 750 aa  63.9  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0363871  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0174  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  21.05 
 
 		 846 aa  58.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2271  polysaccharide lyase family protein 8  25 
 
 		 809 aa  51.6  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2232  polysaccharide lyase family protein 8  25 
 
 		 809 aa  51.6  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6725  Hyaluronate lyase  23.71 
 
 		 576 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0850  Hyaluronate lyase  25.25 
 
 		 792 aa  51.2  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0390  polysaccharide lyase family protein 8  19.76 
 
 		 985 aa  48.1  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.918566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4208  Hyaluronate lyase  24.61 
 
 		 753 aa  48.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.431721  hitchhiker  0.000853972 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0394  polysaccharide lyase family protein 8  19.66 
 
 		 1003 aa  45.8  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0117  Hyaluronate lyase  20.3 
 
 		 618 aa  45.1  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>