21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0117 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0117  Hyaluronate lyase  100 
 
 		 618 aa  1235    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0125  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  33.33 
 
 		 739 aa  246  6e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2232  polysaccharide lyase family protein 8  29.29 
 
 		 809 aa  195  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2271  polysaccharide lyase family protein 8  29.29 
 
 		 809 aa  195  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6725  Hyaluronate lyase  26.97 
 
 		 576 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1197  hyaluronate lyase  28.45 
 
 		 1072 aa  163  7e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3227  Hyaluronate lyase  26.49 
 
 		 1131 aa  162  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0850  Hyaluronate lyase  24.9 
 
 		 792 aa  154  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1698  hyaluronate lyase  24.86 
 
 		 793 aa  153  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222511  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0390  polysaccharide lyase family protein 8  28.85 
 
 		 985 aa  153  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.918566  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0352  hyaluronate lyase  27.94 
 
 		 791 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0394  polysaccharide lyase family protein 8  28.85 
 
 		 1003 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4208  Hyaluronate lyase  23.53 
 
 		 753 aa  136  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.431721  hitchhiker  0.000853972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4980  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  23.98 
 
 		 797 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00611188  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4062  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  21.62 
 
 		 892 aa  103  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.505411  normal  0.685622 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0174  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  24.62 
 
 		 846 aa  87.4  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0500  polysaccharide lyase family 8  19.59 
 
 		 533 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346359  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4325  chondroitin AC lyase  20.59 
 
 		 693 aa  63.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7449  hypothetical protein  21.84 
 
 		 636 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0786  polysaccharide lyase family 8  26.17 
 
 		 700 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3863  Chondroitin AC lyase  20.3 
 
 		 656 aa  45.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.569924  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>