24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4062 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4062  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  100 
 
 		 892 aa  1779    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.505411  normal  0.685622 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3227  Hyaluronate lyase  29.38 
 
 		 1131 aa  290  6e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1698  hyaluronate lyase  31.1 
 
 		 793 aa  274  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4980  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  29.31 
 
 		 797 aa  255  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00611188  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0390  polysaccharide lyase family protein 8  24.72 
 
 		 985 aa  253  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.918566  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0394  polysaccharide lyase family protein 8  24.18 
 
 		 1003 aa  247  6e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0352  hyaluronate lyase  25.62 
 
 		 791 aa  247  9e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0850  Hyaluronate lyase  30.14 
 
 		 792 aa  238  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4208  Hyaluronate lyase  30.4 
 
 		 753 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.431721  hitchhiker  0.000853972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6725  Hyaluronate lyase  31.22 
 
 		 576 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2271  polysaccharide lyase family protein 8  22.94 
 
 		 809 aa  152  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2232  polysaccharide lyase family protein 8  22.94 
 
 		 809 aa  152  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0125  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  23.04 
 
 		 739 aa  136  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0174  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  24.58 
 
 		 846 aa  133  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1197  hyaluronate lyase  20.83 
 
 		 1072 aa  134  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0117  Hyaluronate lyase  21.62 
 
 		 618 aa  102  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0786  polysaccharide lyase family 8  22.94 
 
 		 700 aa  98.6  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7449  hypothetical protein  32.67 
 
 		 636 aa  86.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4325  chondroitin AC lyase  25.29 
 
 		 693 aa  75.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3979  polysaccharide lyase family 8  23.77 
 
 		 718 aa  69.3  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  21.48 
 
 		 929 aa  55.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0500  polysaccharide lyase family 8  27.11 
 
 		 533 aa  54.3  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2256  chondroitinase  23.94 
 
 		 1043 aa  54.3  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0784  Lyase catalytic  23.47 
 
 		 1030 aa  47.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>