47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1751 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1751  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 
576 aa  1206    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3519  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  48.18 
 
 
640 aa  572  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3298  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.05 
 
 
593 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.679676  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4540  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.65 
 
 
616 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  29.57 
 
 
506 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  26.39 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.57 
 
 
577 aa  60.5  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  31.55 
 
 
327 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.71 
 
 
915 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  29.75 
 
 
306 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.69 
 
 
986 aa  55.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.58 
 
 
344 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.77 
 
 
929 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  29.51 
 
 
644 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  25.47 
 
 
319 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  28.67 
 
 
1135 aa  51.2  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  27.81 
 
 
348 aa  49.3  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.25 
 
 
953 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.2 
 
 
330 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  26.24 
 
 
344 aa  48.5  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.58 
 
 
1109 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  27.41 
 
 
524 aa  47.4  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  29.08 
 
 
392 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  28.09 
 
 
315 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.84 
 
 
795 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  21.94 
 
 
367 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  27.53 
 
 
315 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  47.83 
 
 
346 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.82 
 
 
1158 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  25.41 
 
 
487 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  28.9 
 
 
829 aa  45.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  21.8 
 
 
519 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  26.06 
 
 
752 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  29.06 
 
 
533 aa  45.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.77 
 
 
933 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3109  glycoside hydrolase family protein  29.14 
 
 
348 aa  44.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  25.09 
 
 
319 aa  44.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  22.19 
 
 
566 aa  44.3  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  23.12 
 
 
512 aa  44.3  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  28.09 
 
 
315 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  45.65 
 
 
385 aa  44.3  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.19 
 
 
346 aa  44.3  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  29.13 
 
 
450 aa  44.3  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0197  endo-beta-N-acetylglucosaminidase D  27.22 
 
 
927 aa  44.3  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  41.67 
 
 
588 aa  44.3  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  31.9 
 
 
468 aa  43.9  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  24.89 
 
 
393 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.812392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>