123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4311 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  50.41 
 
 
850 aa  675    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 
755 aa  1509    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  67.54 
 
 
940 aa  783    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6657  secreted protein  70.98 
 
 
645 aa  840    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1385  secreted protein  53.78 
 
 
627 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.195328  decreased coverage  0.000365007 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.23 
 
 
722 aa  580  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.74 
 
 
962 aa  546  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1718  secreted protein  54.56 
 
 
562 aa  543  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal  0.917754 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0398  secreted protein  50.77 
 
 
640 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2395  Fibronectin type III domain protein  51.55 
 
 
844 aa  533  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527977  decreased coverage  0.000101055 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3740  secreted protein  49.58 
 
 
640 aa  512  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253884  hitchhiker  0.00713649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  43.93 
 
 
918 aa  470  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1518  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  43.78 
 
 
734 aa  454  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000763318  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1669  secreted protein  42.98 
 
 
622 aa  450  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180028  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  43.55 
 
 
732 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  40.77 
 
 
2117 aa  411  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2668  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40.61 
 
 
652 aa  403  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1676  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  41.44 
 
 
648 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0054  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.02 
 
 
537 aa  363  9e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0200  hypothetical protein  35.41 
 
 
726 aa  274  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5709  hypothetical protein  35.47 
 
 
722 aa  269  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  88.44 
 
 
1007 aa  258  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  70.29 
 
 
987 aa  194  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  70.23 
 
 
674 aa  190  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  75.81 
 
 
1158 aa  177  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  77.42 
 
 
815 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  50 
 
 
578 aa  167  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  53.63 
 
 
433 aa  167  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  59.59 
 
 
581 aa  160  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  61.04 
 
 
588 aa  157  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  60.81 
 
 
449 aa  150  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  54.33 
 
 
637 aa  148  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.23 
 
 
756 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  69.23 
 
 
639 aa  144  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  49.13 
 
 
571 aa  141  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  53.94 
 
 
999 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  60 
 
 
578 aa  138  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  54.62 
 
 
929 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  54.4 
 
 
1441 aa  137  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  53.91 
 
 
752 aa  137  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  52.8 
 
 
953 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  49.28 
 
 
819 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.71 
 
 
1321 aa  131  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  49.29 
 
 
1581 aa  130  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.67 
 
 
1564 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  60 
 
 
452 aa  127  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  48.8 
 
 
392 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  48.18 
 
 
879 aa  125  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  50.4 
 
 
1070 aa  124  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  51.2 
 
 
1103 aa  122  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  39.41 
 
 
732 aa  121  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  54.17 
 
 
1338 aa  121  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.44 
 
 
971 aa  120  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  47.01 
 
 
1059 aa  120  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  40.12 
 
 
558 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  47.48 
 
 
801 aa  117  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.55 
 
 
729 aa  114  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  40.38 
 
 
4013 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.61 
 
 
1117 aa  110  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  37.5 
 
 
1028 aa  107  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  51.94 
 
 
1059 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.74 
 
 
984 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.52 
 
 
915 aa  105  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.96 
 
 
1362 aa  99.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  46.6 
 
 
695 aa  95.5  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  39.01 
 
 
1471 aa  94.4  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  48.21 
 
 
480 aa  94.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  47.32 
 
 
487 aa  93.6  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  47.32 
 
 
487 aa  93.6  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  44.37 
 
 
471 aa  93.6  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  41.18 
 
 
1332 aa  92.8  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  50.46 
 
 
472 aa  91.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  50.46 
 
 
472 aa  91.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.04 
 
 
1139 aa  91.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  51.38 
 
 
470 aa  90.9  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  36.57 
 
 
722 aa  85.1  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.14 
 
 
820 aa  84  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  48.21 
 
 
475 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  47.71 
 
 
470 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  46.79 
 
 
470 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.76 
 
 
1060 aa  73.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.62 
 
 
929 aa  70.1  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.93 
 
 
1448 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 
1184 aa  65.1  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  37.59 
 
 
1439 aa  63.5  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.6 
 
 
1212 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  34.88 
 
 
644 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.03 
 
 
1001 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4863  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  35.96 
 
 
112 aa  62.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483102  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.19 
 
 
795 aa  61.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.67 
 
 
478 aa  60.8  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7141  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.53 
 
 
538 aa  60.8  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.08 
 
 
986 aa  60.5  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  31.22 
 
 
1213 aa  58.9  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1702  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.95 
 
 
1038 aa  58.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0553  discoidin domain-containing protein  33.33 
 
 
1061 aa  57  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  37.36 
 
 
1200 aa  57  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  32.39 
 
 
912 aa  55.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.44 
 
 
933 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  30 
 
 
899 aa  55.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>