157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2795 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  100 
 
 		 912 aa  1852    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  59.69 
 
 		 501 aa  160  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  45 
 
 		 1122 aa  159  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  54.89 
 
 		 604 aa  156  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  56.69 
 
 		 1015 aa  152  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  42.05 
 
 		 780 aa  152  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  43.01 
 
 		 536 aa  150  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  54.26 
 
 		 490 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  52.94 
 
 		 1164 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  42.7 
 
 		 928 aa  149  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  36.04 
 
 		 951 aa  149  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  53.08 
 
 		 629 aa  148  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  41.95 
 
 		 965 aa  147  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  53.54 
 
 		 541 aa  145  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  57.02 
 
 		 818 aa  145  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  55.64 
 
 		 509 aa  144  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  52.31 
 
 		 746 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  37.05 
 
 		 873 aa  142  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 		 524 aa  141  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  50.35 
 
 		 768 aa  140  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  54.24 
 
 		 679 aa  130  8.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  51.06 
 
 		 533 aa  129  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  38.31 
 
 		 535 aa  125  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  46.15 
 
 		 618 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  51.64 
 
 		 748 aa  118  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  45.59 
 
 		 1290 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  44.19 
 
 		 464 aa  114  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  45.31 
 
 		 683 aa  110  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3272  hypothetical protein  42.42 
 
 		 552 aa  109  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000109169  hitchhiker  0.00653931 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  39.74 
 
 		 837 aa  109  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2478  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  43.1 
 
 		 524 aa  104  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  43.28 
 
 		 566 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1503  ATPase  45.53 
 
 		 674 aa  101  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000259399  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  41.04 
 
 		 470 aa  100  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.54 
 
 		 1246 aa  95.1  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  40.16 
 
 		 630 aa  94.4  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.71 
 
 		 945 aa  92.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  40.62 
 
 		 469 aa  92.4  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  41.04 
 
 		 464 aa  89.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  38.06 
 
 		 479 aa  86.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4065  F5/8 type C domain-containing protein  34.11 
 
 		 159 aa  84.7  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.1 
 
 		 953 aa  84.7  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0097  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  34.11 
 
 		 159 aa  84.7  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4066  F5/8 type C domain-containing protein  34.11 
 
 		 159 aa  84.3  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.639135 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  33.58 
 
 		 479 aa  83.2  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  40.65 
 
 		 988 aa  80.1  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0610  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.06 
 
 		 159 aa  80.1  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0826  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.06 
 
 		 159 aa  79.3  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0155823  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  37.8 
 
 		 536 aa  78.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  35.43 
 
 		 630 aa  76.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  35.66 
 
 		 1186 aa  76.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  34.13 
 
 		 884 aa  73.9  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  33.09 
 
 		 541 aa  72.8  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  32.9 
 
 		 982 aa  72  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  37.5 
 
 		 1505 aa  71.2  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  38.58 
 
 		 389 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  33.82 
 
 		 1338 aa  70.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  32.54 
 
 		 957 aa  68.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  34.88 
 
 		 1444 aa  67  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  30.69 
 
 		 610 aa  65.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  35.97 
 
 		 726 aa  66.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  36.89 
 
 		 712 aa  65.5  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  34.68 
 
 		 863 aa  63.9  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  29.85 
 
 		 450 aa  63.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2406  beta-glucosidase  36.8 
 
 		 934 aa  63.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  34.23 
 
 		 401 aa  62  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  35.48 
 
 		 639 aa  62  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  35.96 
 
 		 819 aa  61.2  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  34.62 
 
 		 802 aa  61.2  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2547  translation initiation factor SUI1  36.27 
 
 		 611 aa  59.7  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.858491  hitchhiker  0.00146085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  35.48 
 
 		 877 aa  60.1  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  33.33 
 
 		 673 aa  60.1  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  30.88 
 
 		 1167 aa  59.7  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  34.51 
 
 		 1356 aa  59.3  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  41.98 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.23 
 
 		 1321 aa  58.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  33.63 
 
 		 823 aa  58.9  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  33.63 
 
 		 845 aa  58.2  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  25.32 
 
 		 667 aa  57  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  30.15 
 
 		 1132 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.86 
 
 		 639 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  31.03 
 
 		 644 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.65 
 
 		 962 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  35.25 
 
 		 987 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  33.63 
 
 		 870 aa  56.2  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  30.53 
 
 		 1391 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  36.22 
 
 		 1471 aa  56.2  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.03 
 
 		 1200 aa  56.2  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  30 
 
 		 971 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 705 aa  55.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.09 
 
 		 444 aa  55.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  31.58 
 
 		 1338 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  38.18 
 
 		 850 aa  55.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  28.43 
 
 		 801 aa  55.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  31.58 
 
 		 433 aa  55.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.5 
 
 		 755 aa  55.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.2 
 
 		 1158 aa  55.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  34.41 
 
 		 797 aa  55.1  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  30.97 
 
 		 1380 aa  55.1  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.25 
 
 		 984 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>