25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0610 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0610  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 		 159 aa  322  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0826  coagulation factor 5/8 type domain protein  98.11 
 
 		 159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0155823  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0097  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  67.09 
 
 		 159 aa  226  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4066  F5/8 type C domain-containing protein  67.09 
 
 		 159 aa  226  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.639135 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4065  F5/8 type C domain-containing protein  66.46 
 
 		 159 aa  225  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  33.61 
 
 		 768 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  32.06 
 
 		 912 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  31.85 
 
 		 873 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  33.33 
 
 		 748 aa  70.9  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  29.93 
 
 		 818 aa  67.4  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1503  ATPase  32.8 
 
 		 674 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000259399  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.32 
 
 		 1246 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.67 
 
 		 986 aa  48.1  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3272  hypothetical protein  28.07 
 
 		 552 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000109169  hitchhiker  0.00653931 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  28.31 
 
 		 2095 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2478  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.05 
 
 		 524 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  29.55 
 
 		 1439 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.85 
 
 		 695 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0803  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.18 
 
 		 712 aa  44.7  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.969227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  27.11 
 
 		 2095 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.62 
 
 		 820 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1016  glycoside hydrolase family protein  29.7 
 
 		 880 aa  41.2  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  26.21 
 
 		 1103 aa  41.2  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1751  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  29.21 
 
 		 1088 aa  40.8  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.69 
 
 		 1212 aa  40.8  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>