202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2832 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  100 
 
 		 877 aa  1780    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  42.64 
 
 		 610 aa  177  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  38.02 
 
 		 863 aa  168  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  41.44 
 
 		 673 aa  167  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  39.22 
 
 		 1391 aa  152  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  35.77 
 
 		 1167 aa  146  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  36.9 
 
 		 982 aa  140  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  36.68 
 
 		 569 aa  134  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  48.72 
 
 		 869 aa  117  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  32.7 
 
 		 918 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  30.86 
 
 		 1091 aa  106  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  44.53 
 
 		 536 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  30.19 
 
 		 1707 aa  105  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  48.28 
 
 		 705 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  41.13 
 
 		 884 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  45 
 
 		 639 aa  99.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  43.48 
 
 		 1132 aa  99  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  42.86 
 
 		 389 aa  99  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  31.98 
 
 		 954 aa  99  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  39.39 
 
 		 957 aa  98.2  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  40.62 
 
 		 541 aa  95.5  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 726 aa  93.2  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  23.41 
 
 		 742 aa  89.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  40.83 
 
 		 465 aa  89  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  41.73 
 
 		 383 aa  88.2  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  38.14 
 
 		 853 aa  85.9  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.32 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  36.09 
 
 		 550 aa  83.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  40.71 
 
 		 948 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  41.28 
 
 		 1024 aa  80.9  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  42.06 
 
 		 500 aa  80.9  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.68 
 
 		 1321 aa  80.5  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  32.09 
 
 		 503 aa  80.1  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  23.96 
 
 		 532 aa  79  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  40 
 
 		 928 aa  77  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  27.34 
 
 		 1262 aa  77.4  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  23.64 
 
 		 1234 aa  76.6  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  37.5 
 
 		 470 aa  75.5  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  38.71 
 
 		 951 aa  75.1  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  27.64 
 
 		 526 aa  74.7  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  40.37 
 
 		 461 aa  74.3  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  25.9 
 
 		 1035 aa  72.8  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  37.12 
 
 		 490 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  22.34 
 
 		 694 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  34.64 
 
 		 965 aa  72  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  29.29 
 
 		 1295 aa  71.6  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  25.57 
 
 		 679 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.13 
 
 		 884 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  43.14 
 
 		 819 aa  69.3  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  26.98 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  25.81 
 
 		 1338 aa  68.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.04 
 
 		 933 aa  68.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  28.04 
 
 		 630 aa  67.8  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1175  agarase  26.53 
 
 		 598 aa  67  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000232044  unclonable  0.000000011081 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  34.68 
 
 		 501 aa  67  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  25.52 
 
 		 1799 aa  67.8  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  23.95 
 
 		 912 aa  67.4  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  43.43 
 
 		 870 aa  67  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  35.79 
 
 		 1004 aa  66.6  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.85 
 
 		 945 aa  67  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  34.13 
 
 		 469 aa  66.2  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  24.1 
 
 		 276 aa  66.2  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  37.37 
 
 		 845 aa  65.1  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  33.83 
 
 		 1164 aa  65.1  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  34.78 
 
 		 801 aa  65.1  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  30.19 
 
 		 930 aa  64.7  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  39.39 
 
 		 1356 aa  64.7  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  34.92 
 
 		 566 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  40.4 
 
 		 823 aa  63.9  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2655  agarase  24.2 
 
 		 1335 aa  63.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0452542  normal  0.27666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  23.81 
 
 		 291 aa  63.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.64 
 
 		 1694 aa  62.4  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  24.11 
 
 		 1321 aa  61.6  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  35.48 
 
 		 1015 aa  62  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  34.93 
 
 		 802 aa  61.6  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  35.54 
 
 		 1122 aa  61.6  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  39.39 
 
 		 1380 aa  61.2  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  34.72 
 
 		 719 aa  61.6  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  26.27 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  22.34 
 
 		 1332 aa  60.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  35.48 
 
 		 912 aa  60.1  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  33.33 
 
 		 1441 aa  59.7  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  35.48 
 
 		 604 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  23.7 
 
 		 1918 aa  58.9  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  32.12 
 
 		 735 aa  58.9  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.44 
 
 		 1884 aa  58.9  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  20.91 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  40.86 
 
 		 840 aa  58.5  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  33.08 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2687  hypothetical protein  50.67 
 
 		 1518 aa  58.5  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0579108  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  33.33 
 
 		 1290 aa  57.8  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  32.2 
 
 		 746 aa  58.2  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  40 
 
 		 1109 aa  57.8  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  46.15 
 
 		 4978 aa  57.8  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  39.25 
 
 		 786 aa  57.8  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  32.74 
 
 		 798 aa  57.8  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  31.67 
 
 		 683 aa  57.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  24.7 
 
 		 809 aa  57.4  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  24.19 
 
 		 328 aa  57  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  35 
 
 		 509 aa  57  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>