80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2687 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2687  hypothetical protein  100 
 
 
1518 aa  2979    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0579108  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  32.65 
 
 
1668 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  33.5 
 
 
4978 aa  75.5  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2349  hypothetical protein  45.83 
 
 
974 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  45.87 
 
 
5745 aa  72.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  44 
 
 
1597 aa  72.4  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  39.84 
 
 
1269 aa  70.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  39.02 
 
 
1268 aa  68.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.3 
 
 
994 aa  67.8  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.3 
 
 
761 aa  67.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.3 
 
 
850 aa  67.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.2 
 
 
2114 aa  65.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.3 
 
 
369 aa  66.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.05 
 
 
2346 aa  64.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  40.82 
 
 
1781 aa  63.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  49.3 
 
 
1269 aa  63.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  40.66 
 
 
721 aa  63.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  27.08 
 
 
1488 aa  62.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  38.05 
 
 
3191 aa  62.4  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  47.83 
 
 
1141 aa  61.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  41.05 
 
 
2816 aa  60.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  50.72 
 
 
1706 aa  60.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.44 
 
 
4122 aa  60.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  41.11 
 
 
1752 aa  59.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  42.55 
 
 
3474 aa  59.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  44.44 
 
 
2377 aa  59.7  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  40.38 
 
 
3927 aa  59.7  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0237  hypothetical protein  34.78 
 
 
1006 aa  58.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0211048 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  40.59 
 
 
3486 aa  58.9  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  41.23 
 
 
1744 aa  58.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  35.83 
 
 
16322 aa  58.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  38.52 
 
 
4854 aa  58.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  45.31 
 
 
5444 aa  58.2  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  38.98 
 
 
1879 aa  58.2  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  50.67 
 
 
877 aa  58.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  36.44 
 
 
892 aa  57.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  35.29 
 
 
1538 aa  57.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  38.61 
 
 
1512 aa  57.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2611  hypothetical protein  29.06 
 
 
2924 aa  57  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  36.96 
 
 
1416 aa  56.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.32 
 
 
1066 aa  56.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  43.66 
 
 
8321 aa  56.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.67 
 
 
1884 aa  55.8  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1858  hypothetical protein  30.32 
 
 
888 aa  55.5  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276956 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  36.17 
 
 
1394 aa  54.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  37.5 
 
 
1367 aa  53.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.68 
 
 
3816 aa  53.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  41.18 
 
 
1287 aa  53.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  30.09 
 
 
5769 aa  52.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  29.14 
 
 
2555 aa  52.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  33.8 
 
 
982 aa  52.4  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  30.99 
 
 
1712 aa  51.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  29.05 
 
 
663 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01568  putative unknown lipoprotein  44.26 
 
 
157 aa  50.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.23 
 
 
846 aa  50.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.46 
 
 
1673 aa  49.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  42.35 
 
 
4848 aa  49.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  31.5 
 
 
2503 aa  49.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  42.42 
 
 
1022 aa  49.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  45.65 
 
 
4748 aa  48.9  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  39.36 
 
 
1502 aa  48.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.11 
 
 
3363 aa  48.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  31.5 
 
 
3699 aa  48.5  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  53.66 
 
 
4220 aa  48.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  33.02 
 
 
1363 aa  48.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 
3396 aa  47.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  38.54 
 
 
3471 aa  47.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  39.47 
 
 
2267 aa  47.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  38.96 
 
 
2602 aa  47.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.46 
 
 
3699 aa  47.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.54 
 
 
1283 aa  46.6  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0528  peptidase M11, gametolysin  38.46 
 
 
653 aa  47  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  43.24 
 
 
1672 aa  46.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  40.96 
 
 
7284 aa  46.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.08 
 
 
1286 aa  45.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  34.38 
 
 
2839 aa  45.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  30.22 
 
 
3544 aa  45.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.86 
 
 
1236 aa  45.1  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1592  hypothetical protein  34.78 
 
 
570 aa  45.1  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  36.23 
 
 
4231 aa  45.1  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>