100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1911 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  100 
 
 		 1290 aa  2647    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  42.77 
 
 		 951 aa  130  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  48.48 
 
 		 501 aa  127  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  46.21 
 
 		 1164 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  46.56 
 
 		 928 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  45.8 
 
 		 1015 aa  120  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  39.2 
 
 		 629 aa  118  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  45.04 
 
 		 965 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  45.59 
 
 		 912 aa  117  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  43.75 
 
 		 746 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  37.79 
 
 		 490 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  34.08 
 
 		 679 aa  116  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  43.48 
 
 		 604 aa  115  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  38.71 
 
 		 541 aa  113  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  40.54 
 
 		 1122 aa  112  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  36.27 
 
 		 524 aa  111  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  42.21 
 
 		 509 aa  110  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  41.67 
 
 		 536 aa  109  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  40.14 
 
 		 780 aa  108  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  36.46 
 
 		 535 aa  106  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  44.8 
 
 		 618 aa  98.2  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  40.74 
 
 		 470 aa  96.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  38.24 
 
 		 464 aa  96.3  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  36.96 
 
 		 566 aa  90.1  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  37.5 
 
 		 469 aa  90.9  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  42.96 
 
 		 533 aa  86.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  37.23 
 
 		 536 aa  81.6  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  36.23 
 
 		 541 aa  80.5  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  32.4 
 
 		 630 aa  78.2  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  36.51 
 
 		 837 aa  76.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.59 
 
 		 945 aa  76.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.06 
 
 		 953 aa  75.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  32.84 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  29.05 
 
 		 1186 aa  75.5  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  34.78 
 
 		 479 aa  75.5  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  34.67 
 
 		 1444 aa  74.7  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  37.21 
 
 		 389 aa  74.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  32 
 
 		 683 aa  73.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  36.76 
 
 		 479 aa  73.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  24.63 
 
 		 575 aa  70.1  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  35.35 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  32.12 
 
 		 957 aa  68.2  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  31.39 
 
 		 884 aa  68.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  36.89 
 
 		 1505 aa  63.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  32.81 
 
 		 1391 aa  61.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  32 
 
 		 610 aa  61.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  28.91 
 
 		 982 aa  60.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  29.13 
 
 		 1132 aa  60.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  26.03 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  33.33 
 
 		 877 aa  58.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  28.79 
 
 		 465 aa  58.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  35.61 
 
 		 863 aa  57.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  25.12 
 
 		 413 aa  57  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  29.23 
 
 		 630 aa  57.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  31.58 
 
 		 726 aa  56.2  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  32.14 
 
 		 639 aa  56.2  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1260 aa  55.8  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  35.9 
 
 		 383 aa  55.8  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  23.63 
 
 		 414 aa  55.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  23.14 
 
 		 431 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2738  S-layer domain-containing protein  24.32 
 
 		 466 aa  53.5  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.175202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  29.41 
 
 		 673 aa  53.5  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  24.31 
 
 		 1042 aa  53.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3843  S-layer domain protein  22.71 
 
 		 375 aa  53.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  32.53 
 
 		 401 aa  51.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1431  S-layer domain-containing protein  27.6 
 
 		 458 aa  51.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  28.89 
 
 		 1091 aa  50.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  24.31 
 
 		 558 aa  50.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  25.74 
 
 		 500 aa  50.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  22.64 
 
 		 1174 aa  50.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4693  S-layer protein  22.86 
 
 		 268 aa  49.7  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5054  S-layer protein  22.86 
 
 		 268 aa  49.7  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4952  S-layer protein, putative  22.86 
 
 		 272 aa  49.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  31.62 
 
 		 569 aa  49.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  23.65 
 
 		 631 aa  49.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1167 aa  49.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  22.86 
 
 		 880 aa  48.9  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4937  putative S-layer protein  22.86 
 
 		 272 aa  48.5  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  25.94 
 
 		 1847 aa  48.5  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  23.3 
 
 		 2286 aa  48.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4918  putative S-layer protein  24.84 
 
 		 272 aa  48.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0288  hypothetical protein  23.88 
 
 		 906 aa  47  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4533  S-layer protein  32.61 
 
 		 257 aa  47  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4632  Excalibur domain-containing protein  29.03 
 
 		 266 aa  47  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.03 
 
 		 1200 aa  47.8  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  34.57 
 
 		 733 aa  46.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  26.42 
 
 		 755 aa  46.2  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  26.72 
 
 		 506 aa  46.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0422  cell wall/surface repeat protein  22.71 
 
 		 1729 aa  45.8  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00920532  hitchhiker  0.0000607429 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  29.91 
 
 		 461 aa  45.8  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4550  S-layer protein  30.11 
 
 		 276 aa  45.8  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  27.22 
 
 		 667 aa  46.2  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  22.71 
 
 		 1226 aa  45.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3466  Excalibur domain-containing protein  23.79 
 
 		 272 aa  45.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1817  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.54 
 
 		 414 aa  45.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000725042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1862  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  24.54 
 
 		 414 aa  45.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.72375e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1682  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.54 
 
 		 414 aa  45.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000845994  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1024 aa  45.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  22.71 
 
 		 546 aa  45.1  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  27.83 
 
 		 801 aa  45.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>