More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2680 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  100 
 
 
1174 aa  2407    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  39.04 
 
 
1168 aa  766    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  43.29 
 
 
932 aa  455  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  29.88 
 
 
1194 aa  140  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.92 
 
 
995 aa  137  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  38.89 
 
 
1009 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.76 
 
 
1016 aa  137  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  33.58 
 
 
457 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  30.51 
 
 
573 aa  134  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  42.2 
 
 
223 aa  132  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  38.92 
 
 
935 aa  132  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  30.28 
 
 
548 aa  129  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  38.71 
 
 
1710 aa  128  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  34.63 
 
 
693 aa  129  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.9 
 
 
6885 aa  128  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  38.42 
 
 
754 aa  127  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  39.66 
 
 
1042 aa  127  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  34.52 
 
 
618 aa  127  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  37.3 
 
 
506 aa  126  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1458  hypothetical protein  53.98 
 
 
252 aa  124  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  32.33 
 
 
820 aa  124  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2679  hypothetical protein  49.21 
 
 
234 aa  123  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  30.77 
 
 
1847 aa  122  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.52 
 
 
1029 aa  122  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  34.67 
 
 
1821 aa  121  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  31.84 
 
 
524 aa  120  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  33.98 
 
 
756 aa  120  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  39.67 
 
 
548 aa  119  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  36.49 
 
 
629 aa  118  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  41.77 
 
 
625 aa  117  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  40 
 
 
758 aa  117  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  30.56 
 
 
2207 aa  117  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  36.16 
 
 
1013 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  36.93 
 
 
518 aa  114  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  33.33 
 
 
685 aa  113  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  36.95 
 
 
921 aa  112  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  29.32 
 
 
1260 aa  111  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  31.84 
 
 
631 aa  110  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  34.71 
 
 
288 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  35.29 
 
 
1226 aa  109  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  32.94 
 
 
1081 aa  108  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  35.11 
 
 
710 aa  108  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4398  S-layer protein  37.79 
 
 
620 aa  108  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740229  hitchhiker  0.00000000000010382 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0784  S-layer domain-containing protein  37.79 
 
 
620 aa  108  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000163217  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  31.29 
 
 
1321 aa  108  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0933  S-layer protein  37.21 
 
 
620 aa  108  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000133918  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  32.02 
 
 
554 aa  107  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  39.05 
 
 
1223 aa  107  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  33.71 
 
 
920 aa  106  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  30.41 
 
 
2286 aa  106  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  33.53 
 
 
926 aa  105  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  36.26 
 
 
526 aa  105  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  31.47 
 
 
4630 aa  104  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  33 
 
 
1421 aa  103  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  34.71 
 
 
531 aa  103  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  31.25 
 
 
733 aa  102  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0560  hypothetical protein  49.53 
 
 
243 aa  102  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.962196  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  34.3 
 
 
880 aa  102  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0608  S-layer domain protein  28.22 
 
 
547 aa  101  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.453799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3210  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.21 
 
 
533 aa  101  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.93 
 
 
1054 aa  101  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  30.6 
 
 
506 aa  100  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  32.91 
 
 
631 aa  100  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  34.54 
 
 
1208 aa  101  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  39.56 
 
 
767 aa  100  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5468  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.63 
 
 
533 aa  100  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000294756  normal  0.0109567 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.67 
 
 
1328 aa  99.8  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  33.15 
 
 
693 aa  99.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0777  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.63 
 
 
567 aa  98.6  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173449  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  34.21 
 
 
692 aa  98.6  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0925  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.48 
 
 
572 aa  98.2  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.91 
 
 
567 aa  96.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000032251 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2877  S-layer-like domain-containing protein  33.15 
 
 
585 aa  96.3  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3111  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.48 
 
 
539 aa  95.5  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000635651  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1682  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.2 
 
 
414 aa  95.1  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000845994  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  23.9 
 
 
1495 aa  95.1  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1862  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  35.2 
 
 
414 aa  95.1  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.72375e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1628  S-layer protein and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion protein  35.2 
 
 
413 aa  95.1  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000159428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1817  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.2 
 
 
414 aa  95.1  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000725042  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1890  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.52 
 
 
470 aa  94.7  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00294488  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  31.52 
 
 
552 aa  94.7  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3446  S-layer domain-containing protein  32.82 
 
 
876 aa  93.2  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0789  S-layer protein sap precursor  34.46 
 
 
814 aa  92.8  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200088  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1939  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  34.83 
 
 
470 aa  92.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000781755  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0841  S-layer protein Sap  34.46 
 
 
814 aa  92  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0885  s-layer protein sap  34.46 
 
 
814 aa  92  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  31.91 
 
 
3027 aa  91.7  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  34.29 
 
 
807 aa  91.7  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1376  S-layer domain protein  30.11 
 
 
594 aa  91.3  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000547431  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2644  cell wall/surface repeat protein  29.85 
 
 
2178 aa  90.9  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.615501  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.6 
 
 
1661 aa  90.9  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  31.82 
 
 
939 aa  90.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0788  S-layer protein, peptidoglycan endo-beta-N-acetylglucosaminidase and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion  36.65 
 
 
615 aa  90.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  0.00000000000000356588  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  30.34 
 
 
755 aa  90.1  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  33.52 
 
 
333 aa  90.5  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2329  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.79 
 
 
596 aa  90.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3449  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.15 
 
 
843 aa  89.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1938  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  32.4 
 
 
414 aa  89.4  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000112204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  31.46 
 
 
530 aa  89  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1629  S-layer protein  33.71 
 
 
470 aa  89.4  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00040233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>