More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0293 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  100 
 
 		 1260 aa  2556    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  46.12 
 
 		 1495 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.25 
 
 		 1661 aa  320  1e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  35.06 
 
 		 935 aa  199  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  43.09 
 
 		 733 aa  160  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  38.28 
 
 		 548 aa  155  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  29.14 
 
 		 573 aa  154  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  32.53 
 
 		 756 aa  154  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  35.54 
 
 		 932 aa  149  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.8 
 
 		 1016 aa  132  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  30.49 
 
 		 1847 aa  131  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.8 
 
 		 6885 aa  130  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  27.39 
 
 		 618 aa  126  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  32.6 
 
 		 1009 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.43 
 
 		 1328 aa  120  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  29.57 
 
 		 524 aa  120  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.09 
 
 		 1054 aa  120  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  34.55 
 
 		 1226 aa  120  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  34.9 
 
 		 554 aa  119  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  35.68 
 
 		 921 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  30.29 
 
 		 920 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  26.79 
 
 		 1168 aa  115  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  34.95 
 
 		 926 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  35.16 
 
 		 548 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  33.87 
 
 		 506 aa  112  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  36.16 
 
 		 1321 aa  113  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  35.03 
 
 		 457 aa  112  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  34.64 
 
 		 526 aa  112  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  29.32 
 
 		 1174 aa  112  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0298  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1457 aa  112  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00924887  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.89 
 
 		 1029 aa  110  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0608  S-layer domain protein  34.38 
 
 		 547 aa  108  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.453799  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  29.56 
 
 		 531 aa  108  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3019  S-layer domain protein  32.81 
 
 		 609 aa  108  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  40 
 
 		 1050 aa  106  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  33.33 
 
 		 506 aa  107  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  32.22 
 
 		 625 aa  106  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.63 
 
 		 995 aa  106  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  30.89 
 
 		 2073 aa  105  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  35.08 
 
 		 685 aa  105  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  35.14 
 
 		 518 aa  105  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  32.4 
 
 		 758 aa  104  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  34.27 
 
 		 1208 aa  104  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  35.33 
 
 		 693 aa  103  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  32.42 
 
 		 1710 aa  102  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  30.65 
 
 		 1821 aa  102  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  31.44 
 
 		 2375 aa  102  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  31.11 
 
 		 1013 aa  100  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  29.41 
 
 		 624 aa  100  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  29.45 
 
 		 631 aa  99.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  31.82 
 
 		 1081 aa  99.8  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  25.3 
 
 		 2286 aa  99.8  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  31.55 
 
 		 820 aa  99.4  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  31.36 
 
 		 729 aa  99  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000080624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  31.67 
 
 		 2207 aa  97.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  29.94 
 
 		 1194 aa  97.8  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  29.38 
 
 		 3320 aa  95.9  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  31 
 
 		 629 aa  95.9  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  34.59 
 
 		 767 aa  95.5  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  32.6 
 
 		 1223 aa  94.7  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  29.29 
 
 		 414 aa  94.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  28.18 
 
 		 4630 aa  93.6  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  30.81 
 
 		 710 aa  92.8  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  30.39 
 
 		 288 aa  92  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2877  S-layer-like domain-containing protein  34.04 
 
 		 585 aa  90.5  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  25.54 
 
 		 693 aa  89.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  30.43 
 
 		 1042 aa  89  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  29.57 
 
 		 834 aa  88.2  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  29.28 
 
 		 1421 aa  88.2  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  29.35 
 
 		 542 aa  87  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  30.53 
 
 		 914 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.98 
 
 		 1234 aa  86.3  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0748  hypothetical protein  29.54 
 
 		 388 aa  86.3  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  29.95 
 
 		 552 aa  85.9  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  27.87 
 
 		 223 aa  85.5  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1431  S-layer domain-containing protein  35.59 
 
 		 458 aa  85.1  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  28.57 
 
 		 218 aa  84.7  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  28.19 
 
 		 431 aa  84  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  26.44 
 
 		 755 aa  84  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1890  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.57 
 
 		 470 aa  83.2  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00294488  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  31.11 
 
 		 779 aa  82.8  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0422  cell wall/surface repeat protein  29.65 
 
 		 1729 aa  82.8  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00920532  hitchhiker  0.0000607429 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  28.75 
 
 		 631 aa  82.8  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4159  S-layer domain protein  29.17 
 
 		 220 aa  82.8  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.767768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  25.4 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  34.33 
 
 		 688 aa  82.8  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1939  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  33.51 
 
 		 470 aa  82.4  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000781755  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1180  S-layer domain protein  29.17 
 
 		 220 aa  82.4  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0776761  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  31.79 
 
 		 880 aa  82  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  31.22 
 
 		 822 aa  82  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000577462  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  32 
 
 		 2313 aa  82  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1054  S-layer-like region  25.93 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3449  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.78 
 
 		 843 aa  81.6  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  30.27 
 
 		 546 aa  81.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  28.88 
 
 		 692 aa  81.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  27.32 
 
 		 558 aa  80.9  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  31.33 
 
 		 6678 aa  81.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1931  S-layer-like domain-containing protein  28.7 
 
 		 521 aa  80.9  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000922492  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1683  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.08 
 
 		 459 aa  80.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00306779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3446  S-layer domain-containing protein  24.63 
 
 		 876 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>