298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0274 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  100 
 
 
779 aa  1588    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  30.16 
 
 
1042 aa  281  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  34.4 
 
 
480 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  30.42 
 
 
3507 aa  129  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  26.9 
 
 
4433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.02 
 
 
6885 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  26.13 
 
 
1973 aa  117  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  26.32 
 
 
2068 aa  117  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  33.87 
 
 
2286 aa  104  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.63 
 
 
1661 aa  97.4  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  30.88 
 
 
573 aa  93.2  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0608  S-layer domain protein  31.18 
 
 
547 aa  92.8  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.453799  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  31.38 
 
 
631 aa  90.9  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.68 
 
 
795 aa  89.7  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  26.99 
 
 
729 aa  87.8  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000080624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  29.5 
 
 
1495 aa  87.8  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  29.85 
 
 
527 aa  85.9  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  31.11 
 
 
1260 aa  83.6  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  30.57 
 
 
2375 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  30.32 
 
 
3320 aa  82.4  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  24.67 
 
 
2286 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  32.97 
 
 
930 aa  81.6  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  31.28 
 
 
1013 aa  81.6  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  28.69 
 
 
506 aa  81.3  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  30.81 
 
 
1847 aa  79.7  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  35.29 
 
 
457 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  28.89 
 
 
548 aa  79.7  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  31.08 
 
 
670 aa  78.6  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  27.9 
 
 
771 aa  78.2  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  29.03 
 
 
1226 aa  77.8  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.98 
 
 
1016 aa  77  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  27.75 
 
 
836 aa  75.1  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  26.82 
 
 
932 aa  75.1  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0298  hypothetical protein  28.34 
 
 
1457 aa  74.3  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00924887  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2792  S-layer domain protein  28.21 
 
 
262 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.557365  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  30.98 
 
 
1009 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  29.94 
 
 
524 aa  72.4  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  26.94 
 
 
1363 aa  72  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  26.44 
 
 
1380 aa  71.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  33.72 
 
 
820 aa  71.2  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3325  S-layer domain protein  27.69 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  27.5 
 
 
518 aa  71.2  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  28 
 
 
1421 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  33.12 
 
 
618 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  28.72 
 
 
935 aa  70.5  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  28.02 
 
 
733 aa  70.5  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  26.6 
 
 
1363 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  29.1 
 
 
526 aa  69.7  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  25.14 
 
 
1174 aa  69.3  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  31.76 
 
 
1050 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  30.68 
 
 
920 aa  69.7  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.74 
 
 
649 aa  70.1  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  27.27 
 
 
841 aa  68.6  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  30.56 
 
 
506 aa  68.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3019  S-layer domain protein  28.5 
 
 
609 aa  67.8  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  28.02 
 
 
756 aa  67.8  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  35.76 
 
 
548 aa  67  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  27.32 
 
 
2073 aa  67  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  27.14 
 
 
1223 aa  67  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1376  S-layer domain protein  27.93 
 
 
594 aa  66.6  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000547431  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3079  S-layer domain-containing protein  31.5 
 
 
360 aa  66.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00407432  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  35.21 
 
 
409 aa  66.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  27.03 
 
 
926 aa  66.2  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  28.08 
 
 
554 aa  65.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  32.79 
 
 
2207 aa  65.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  31.14 
 
 
758 aa  65.5  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3307  S-layer domain protein  29.92 
 
 
360 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  29.21 
 
 
921 aa  65.1  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  22.36 
 
 
680 aa  65.1  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  27.51 
 
 
693 aa  65.1  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  27.55 
 
 
413 aa  65.1  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  28.65 
 
 
1735 aa  64.7  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  27.18 
 
 
558 aa  64.3  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3093  S-layer protein  29.92 
 
 
360 aa  63.9  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000122253  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  38.78 
 
 
340 aa  63.5  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2990  S-layer protein  29.92 
 
 
360 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000541964  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  34.82 
 
 
1821 aa  63.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3315  putative S-layer protein  29.92 
 
 
360 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3338  S-layer protein  29.92 
 
 
360 aa  63.9  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656673  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  31.03 
 
 
2334 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  25.67 
 
 
880 aa  62.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  30.29 
 
 
625 aa  63.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  25.26 
 
 
414 aa  63.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0724  cell wall hydrolase/autolysin  32.21 
 
 
527 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000386208  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  27.42 
 
 
1628 aa  62.4  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  25.84 
 
 
1321 aa  62.4  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  23.12 
 
 
741 aa  62.4  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0079  surface layer protein  28.98 
 
 
404 aa  62  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  2.3790999999999998e-28  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  27.89 
 
 
413 aa  61.6  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  28.08 
 
 
1081 aa  61.2  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1431  S-layer domain-containing protein  27.68 
 
 
458 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  24.77 
 
 
9585 aa  60.8  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.65 
 
 
1029 aa  60.8  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1048  S-layer protein  29.69 
 
 
223 aa  60.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000983689  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  31.78 
 
 
999 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  31.82 
 
 
531 aa  60.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1924  hypothetical protein  32.43 
 
 
657 aa  60.8  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.398091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0089  S-layer domain protein  26.4 
 
 
807 aa  60.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025043 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1127  S-layer protein  29.69 
 
 
223 aa  60.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.600339  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1205  putative S-layer protein  29.69 
 
 
223 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.567806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>