132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0431 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  100 
 
 		 527 aa  1071    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  51.34 
 
 		 462 aa  299  8e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  50 
 
 		 922 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  44.31 
 
 		 594 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  44.55 
 
 		 1316 aa  232  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  43.3 
 
 		 769 aa  225  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  37.13 
 
 		 512 aa  194  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  36.88 
 
 		 365 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  35.08 
 
 		 501 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  41.91 
 
 		 335 aa  178  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  34.9 
 
 		 365 aa  155  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  37.1 
 
 		 327 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  36.22 
 
 		 327 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  34.82 
 
 		 317 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  32.67 
 
 		 375 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  30.72 
 
 		 686 aa  124  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0352  Pectate lyase/Amb allergen  35.93 
 
 		 375 aa  121  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  35.81 
 
 		 482 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0270  Pectate lyase/Amb allergen  32.2 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0353  Pectate lyase/Amb allergen  35.07 
 
 		 376 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  35.87 
 
 		 326 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  33.5 
 
 		 1409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  32.17 
 
 		 794 aa  118  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0271  Pectate lyase/Amb allergen  34.7 
 
 		 375 aa  118  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4036  Pectate lyase/Amb allergen  36.36 
 
 		 374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3859  Pectate lyase/Amb allergen  37.15 
 
 		 374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  47.62 
 
 		 340 aa  117  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  35.82 
 
 		 374 aa  117  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  32.66 
 
 		 374 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  31.84 
 
 		 474 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  31.61 
 
 		 374 aa  111  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  30.22 
 
 		 991 aa  111  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  36.59 
 
 		 1042 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  33.99 
 
 		 380 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4037  Pectate lyase/Amb allergen  29.45 
 
 		 374 aa  109  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  33.33 
 
 		 919 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  32 
 
 		 554 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  26.64 
 
 		 351 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  28.03 
 
 		 435 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  32.65 
 
 		 397 aa  95.5  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  30.99 
 
 		 385 aa  94.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  29.01 
 
 		 368 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  31.68 
 
 		 486 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  26.99 
 
 		 449 aa  91.7  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  30.36 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  32.76 
 
 		 480 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  30.85 
 
 		 522 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  29.74 
 
 		 3507 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  29.85 
 
 		 779 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1178  Pectate lyase/Amb allergen  27.84 
 
 		 498 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000219225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  26.7 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  29.1 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  28.16 
 
 		 436 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  26.8 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  30.35 
 
 		 730 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  31.28 
 
 		 4433 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  31.21 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  29.92 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  27.09 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  39.83 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0132  Pectate lyase/Amb allergen  28.45 
 
 		 505 aa  76.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  28.22 
 
 		 918 aa  73.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  28.8 
 
 		 2068 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.21 
 
 		 649 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  31.61 
 
 		 14944 aa  72  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  36.45 
 
 		 2334 aa  70.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  29.21 
 
 		 1113 aa  70.5  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  31.37 
 
 		 670 aa  70.1  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  38.94 
 
 		 853 aa  70.1  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1503  ATPase  22.99 
 
 		 674 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000259399  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  27.23 
 
 		 504 aa  67.4  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0281  hypothetical protein  34.51 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.342666  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  38.95 
 
 		 580 aa  67.4  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  29.7 
 
 		 836 aa  67  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  31.75 
 
 		 995 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  28.46 
 
 		 776 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  31.47 
 
 		 1199 aa  65.5  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  25.58 
 
 		 841 aa  65.5  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  28.05 
 
 		 1973 aa  64.7  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  27.57 
 
 		 1363 aa  64.3  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  37.66 
 
 		 861 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0459  hypothetical protein  44.44 
 
 		 478 aa  63.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0813872  normal  0.0506125 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3111  peptidase M12B, ADAM/reprolysin  29.89 
 
 		 715 aa  62.4  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.894939  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4283  pectin lyase  27.62 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2321  Fibronectin type III domain protein  27.03 
 
 		 701 aa  61.6  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.75 
 
 		 6885 aa  61.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04882  pectin lyase (Eurofung)  27.42 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.485233 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  39.74 
 
 		 673 aa  60.5  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09439  pectin lyase (Eurofung)  29.11 
 
 		 377 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  27.96 
 
 		 747 aa  59.7  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  26.37 
 
 		 1363 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1777  Pectate lyase/Amb allergen  26.27 
 
 		 314 aa  60.1  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3985  Pectate lyase/Amb allergen  27.14 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  33.96 
 
 		 999 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3108  multicopper oxidase type 2  29 
 
 		 1430 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  33.9 
 
 		 2286 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  28.98 
 
 		 741 aa  58.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  26.99 
 
 		 1380 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.9 
 
 		 795 aa  58.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2491  Fibronectin type III domain protein  35.19 
 
 		 566 aa  57.4  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>