60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0352 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0352  Pectate lyase/Amb allergen  100 
 
 		 375 aa  761    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0353  Pectate lyase/Amb allergen  84.88 
 
 		 376 aa  654    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0270  Pectate lyase/Amb allergen  84.76 
 
 		 375 aa  662    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0271  Pectate lyase/Amb allergen  81.87 
 
 		 375 aa  609  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4037  Pectate lyase/Amb allergen  75.35 
 
 		 374 aa  577  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  75.07 
 
 		 374 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3859  Pectate lyase/Amb allergen  73.53 
 
 		 374 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  73.31 
 
 		 374 aa  549  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4036  Pectate lyase/Amb allergen  73.5 
 
 		 374 aa  545  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  71.91 
 
 		 374 aa  545  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  31.5 
 
 		 1316 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  33.66 
 
 		 769 aa  136  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  30.45 
 
 		 922 aa  135  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  32.86 
 
 		 594 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  32.37 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  30.56 
 
 		 501 aa  123  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  35.23 
 
 		 527 aa  122  8e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  36.93 
 
 		 462 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  29.57 
 
 		 512 aa  119  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  32.79 
 
 		 385 aa  103  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  32.08 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  30.77 
 
 		 317 aa  96.7  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  36 
 
 		 326 aa  94.4  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  33.66 
 
 		 327 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  26.5 
 
 		 1409 aa  94  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  29.92 
 
 		 327 aa  93.2  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  25.91 
 
 		 919 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  30.15 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  30.96 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  29.26 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  31.67 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  29.65 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  29.61 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  30.53 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  26.92 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  35.9 
 
 		 554 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  26.28 
 
 		 747 aa  67.8  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  27.87 
 
 		 686 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  30.32 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  30 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  25.32 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  29.56 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  37.19 
 
 		 449 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  30.43 
 
 		 794 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  28.86 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  30.43 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  36.52 
 
 		 730 aa  60.1  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  29.5 
 
 		 486 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  30.96 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0132  Pectate lyase/Amb allergen  32.35 
 
 		 505 aa  57  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  29.8 
 
 		 522 aa  56.6  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  26.32 
 
 		 504 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  28.84 
 
 		 991 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  24.42 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  27.67 
 
 		 368 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04882  pectin lyase (Eurofung)  25.4 
 
 		 464 aa  47  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.485233 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10147  conserved hypothetical protein  28.31 
 
 		 387 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.705837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1178  Pectate lyase/Amb allergen  25 
 
 		 498 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000219225 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3378  Pectate lyase/Amb allergen  25.95 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02569  Pectin lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA61]  26.89 
 
 		 379 aa  43.5  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>