62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2941 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  100 
 
 		 501 aa  1014    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  80.04 
 
 		 512 aa  795    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  56.98 
 
 		 1316 aa  544  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  57.29 
 
 		 769 aa  529  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  77.17 
 
 		 365 aa  501  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  37.02 
 
 		 594 aa  226  6e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  36.92 
 
 		 527 aa  192  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  35.13 
 
 		 462 aa  178  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  33.33 
 
 		 922 aa  177  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  33.99 
 
 		 335 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0270  Pectate lyase/Amb allergen  32.88 
 
 		 375 aa  134  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4037  Pectate lyase/Amb allergen  33.15 
 
 		 374 aa  133  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0353  Pectate lyase/Amb allergen  31.28 
 
 		 376 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0352  Pectate lyase/Amb allergen  30.17 
 
 		 375 aa  126  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  31.84 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  32.25 
 
 		 374 aa  124  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  39.68 
 
 		 327 aa  123  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  31.17 
 
 		 374 aa  121  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0271  Pectate lyase/Amb allergen  32.59 
 
 		 375 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3859  Pectate lyase/Amb allergen  30.98 
 
 		 374 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4036  Pectate lyase/Amb allergen  30.45 
 
 		 374 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  28.66 
 
 		 686 aa  109  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  31.95 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  31.39 
 
 		 326 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  31.05 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  32.77 
 
 		 1409 aa  104  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  34.33 
 
 		 385 aa  103  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  30.63 
 
 		 380 aa  99  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  32.93 
 
 		 327 aa  98.2  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  30.04 
 
 		 365 aa  97.8  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  34.39 
 
 		 919 aa  94.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  31.42 
 
 		 397 aa  94.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  28.97 
 
 		 474 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  26.33 
 
 		 449 aa  93.6  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  31.42 
 
 		 482 aa  93.6  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  28.28 
 
 		 794 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  29.89 
 
 		 392 aa  89.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  30.36 
 
 		 405 aa  88.2  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  28.03 
 
 		 351 aa  87.8  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  30.66 
 
 		 427 aa  87.8  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1178  Pectate lyase/Amb allergen  27.27 
 
 		 498 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000219225 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  32.22 
 
 		 456 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  28.46 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  30.09 
 
 		 486 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  28.91 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  28.64 
 
 		 730 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  29.88 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  28.72 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  27.75 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  25 
 
 		 991 aa  68.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  26.09 
 
 		 522 aa  67.8  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  27.69 
 
 		 747 aa  63.5  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1371  Pectate lyase/Amb allergen  27.88 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00120054  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  28.57 
 
 		 554 aa  60.5  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1777  Pectate lyase/Amb allergen  26.56 
 
 		 314 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  27.47 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3378  Pectate lyase/Amb allergen  26.39 
 
 		 314 aa  57  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  27.27 
 
 		 504 aa  55.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0132  Pectate lyase/Amb allergen  29.57 
 
 		 505 aa  53.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54059 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04882  pectin lyase (Eurofung)  28.42 
 
 		 464 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.485233 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3839  type III helper protein HopAK1  24.32 
 
 		 543 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0281  hypothetical protein  29.14 
 
 		 143 aa  43.1  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.342666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>