67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5013 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  100 
 
 		 427 aa  863    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  49.88 
 
 		 449 aa  395  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  52.84 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  50.91 
 
 		 427 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  47.04 
 
 		 456 aa  355  1e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  50 
 
 		 730 aa  348  9e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  50.38 
 
 		 436 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0132  Pectate lyase/Amb allergen  37.92 
 
 		 505 aa  286  5.999999999999999e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1178  Pectate lyase/Amb allergen  37.92 
 
 		 498 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000219225 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  36.19 
 
 		 504 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  30.61 
 
 		 522 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  35.84 
 
 		 405 aa  195  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  35.33 
 
 		 380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  37.11 
 
 		 385 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  36.59 
 
 		 402 aa  179  9e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  30.15 
 
 		 397 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  30.92 
 
 		 346 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  32.55 
 
 		 392 aa  163  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  39.41 
 
 		 317 aa  123  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  44 
 
 		 482 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  34.43 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  37.13 
 
 		 327 aa  111  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  30.34 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  33.52 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  30.66 
 
 		 327 aa  100  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  31.3 
 
 		 462 aa  99  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  32.42 
 
 		 486 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  29.41 
 
 		 922 aa  90.9  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  28.4 
 
 		 991 aa  90.5  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  33.5 
 
 		 351 aa  89.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  29.91 
 
 		 527 aa  88.6  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  30.33 
 
 		 501 aa  86.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  30.66 
 
 		 1409 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0280  AAA ATPase family protein  32.32 
 
 		 272 aa  82.8  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.582677  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  30.6 
 
 		 512 aa  82  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  28.91 
 
 		 1316 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  27.83 
 
 		 594 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  27.76 
 
 		 686 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  29.81 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  28.24 
 
 		 769 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  29.25 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  33.68 
 
 		 919 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  34.16 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  29.9 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  29.76 
 
 		 554 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0352  Pectate lyase/Amb allergen  29.65 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4037  Pectate lyase/Amb allergen  30.96 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  33.54 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  30.77 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0271  Pectate lyase/Amb allergen  29.86 
 
 		 375 aa  72  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0270  Pectate lyase/Amb allergen  28.64 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  29.21 
 
 		 794 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  29.21 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0353  Pectate lyase/Amb allergen  31.89 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4036  Pectate lyase/Amb allergen  31.61 
 
 		 374 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3859  Pectate lyase/Amb allergen  30.05 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3985  Pectate lyase/Amb allergen  25.32 
 
 		 421 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4283  pectin lyase  26.18 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3378  Pectate lyase/Amb allergen  25.81 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0281  hypothetical protein  36.84 
 
 		 143 aa  57  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.342666  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1777  Pectate lyase/Amb allergen  25.94 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1371  Pectate lyase/Amb allergen  26.21 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00120054  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7394  Pectate lyase/Amb allergen  25.31 
 
 		 398 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0906839  normal  0.447007 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  27.03 
 
 		 747 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09439  pectin lyase (Eurofung)  24.62 
 
 		 377 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3839  type III helper protein HopAK1  22.96 
 
 		 543 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04882  pectin lyase (Eurofung)  25.58 
 
 		 464 aa  46.6  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.485233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>