30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0280 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0280  AAA ATPase family protein  100 
 
 		 272 aa  560  1.0000000000000001e-159  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.582677  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  32.32 
 
 		 427 aa  82.4  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  30.37 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  42.31 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  26.34 
 
 		 504 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1178  Pectate lyase/Amb allergen  27.73 
 
 		 498 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000219225 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  39.08 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  38.46 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  39.74 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  26.75 
 
 		 456 aa  72.8  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0132  Pectate lyase/Amb allergen  34.59 
 
 		 505 aa  69.3  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  38.2 
 
 		 346 aa  68.9  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  28.12 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  37.5 
 
 		 522 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  35.96 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  28.51 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  26.78 
 
 		 730 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  31.3 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  32.93 
 
 		 392 aa  58.9  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  34.74 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  32.5 
 
 		 686 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  36.17 
 
 		 794 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  36.17 
 
 		 474 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  32.08 
 
 		 365 aa  47.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7394  Pectate lyase/Amb allergen  40.26 
 
 		 398 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0906839  normal  0.447007 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  37.1 
 
 		 368 aa  46.2  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  30.95 
 
 		 527 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  36.11 
 
 		 327 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  36.26 
 
 		 375 aa  43.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  28.05 
 
 		 462 aa  42.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>